当前解析结果
SmilChr05G002140| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002140 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002140 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002140 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 22530003 - 22537975 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986759 |
|---|---|
| GeneID | 130986759 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986759 |
| 原始查询 | LOC130986759 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00098 (zf-CCHC) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986759 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057766253.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057766253.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057766253.1 |
| 4 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057766254.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766253.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057766253.1PF00098
zf-CCHC 114-129 aa
XP_057766254.1PF00098
zf-CCHC 114-129 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057766253.1 |
Pfam | PF00098 |
zf-CCHC | Domain | 114 | 129 | 1.4e-07 | 31.9 | Zinc knuckle |
XP_057766254.1 |
Pfam | PF00098 |
zf-CCHC | Domain | 114 | 129 | 1.4e-07 | 32.0 | Zinc knuckle |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
6 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。