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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002199`

染色体: Chr05 坐标: 23448858-23454364 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002199`
名称	SmilChr05G002199
描述	splicing factor Cactin
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	23448858 - 23454364 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986769`
GeneID	`130986769`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986769`
原始查询	`LOC130986769`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	splicing factor Cactin
产物	splicing factor Cactin
Arabidopsis	`AT1G03910` (AT1G03910) cactus-binding carboxy-terminal, cactin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839371] identity=73.6; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0800100` - identity=76.8; qcov=0.471; evalue=4.49e-142; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005681 (spliceosomal complex); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0045292 (mRNA cis splicing, via spliceosome)
KEGG	-
Pfam	PF09732 (CactinC_cactus); PF10312 (Cactin_mid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986769

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766269.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057766269.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.40000	`XP_057766269.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057766269.1`
5	Chromatin	染色质	0.20000	`XP_057766269.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:23449005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:23449012`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	50	A13,A22,A25,A4,B106,B108,B113,B117,B119,B127,B130,B132,B137,B139,B16,B18,B2,B21,B24,B34,B40,B41,B43,B46,B50,B55,B59,B66,B73,B8,B80,B92,B94,C21,C3,C31,C33,C45,C51,C60,C62,C7,C70,C74,C76,C78,C79,C82,C84,D4
`Chr5:23449015`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	50	A13,A22,A25,A4,B106,B108,B113,B117,B119,B127,B130,B132,B137,B139,B16,B18,B2,B21,B24,B34,B40,B41,B43,B46,B50,B55,B59,B66,B73,B8,B80,B92,B94,C21,C3,C31,C33,C45,C51,C60,C62,C7,C70,C74,C76,C78,C79,C82,C84,D4
`Chr5:23449036`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	B114,B120,B129,B13,B14,B95,C2,C63,D6,D9
`Chr5:23449040`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	56	A13,A22,A25,A4,B106,B108,B113,B117,B119,B127,B130,B132,B137,B139,B16,B18,B2,B21,B23,B24,B34,B40,B41,B43,B46,B50,B55,B59,B66,B72,B73,B8,B80,B87,B92,B94,C21,C3,C31,C33,C45,C51,C54,C60,C62,C7,C70,C73,C74,C76,C78,C79,C82,C84,D4,D6
`Chr5:23450778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B36
`Chr5:23451967`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A16,B104,B128,B129,B139,B140,B16,B38,B39,B63,B7,D5
`Chr5:23452330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B45,C40,C5
`Chr5:23453667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B58,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766269.1

614 aa

307

614

Cactin_mid

CactinC_cactus

PF10312 Cactin_mid 141-338 aa PF09732 CactinC_cactus 490-614 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766269.1`	Pfam	`PF10312`	Cactin_mid	Family	141	338	5.2e-61	206.5	Conserved mid region of cactin
`XP_057766269.1`	Pfam	`PF09732`	CactinC_cactus	Domain	490	614	1.8e-63	212.8	Cactus-binding C-terminus of cactin protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910286.1
GTAAACCCTATTCTCTCGATTAGTAAACCCTATTCTCTCGATTAGGAGTTCCTGCATACCAACCATCTCCTAATCAGTAAACCCTATTCTCTCGACTAGGAGGAGATGCCTCGGCGATCACCTTCCGATTCTGACCGAAAGCATAAGCGGCGACGCCGCCACTCTGATTCGGAGGAGCCATCTAGGCGGAAGATTACCGAGGATGAGATTACTGAGTATCTCGCTAAGAAGGCTCAGAAGAAGGCTATGAAAGTTGCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986769
ATGCCTCGGCGATCACCTTCCGATTCTGACCGAAAGCATAAGCGGCGACGCCGCCACTCTGATTCGGAGGAGCCATCTAGGCGGAAGATTACCGAGGATGAGATTACTGAGTATCTCGCTAAGAAGGCTCAGAAGAAGGCTATGAAAGTTGCGAAGAAATTGAAGTTGCAGAGCAAAGACGTATCCGGTTATTCCAACGATTCGAATCCCTTTGGTGATTCTAATTTGAATGAAAAATTTGTGTGGAGAAAGAAGATTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766269.1
MPRRSPSDSDRKHKRRRRHSDSEEPSRRKITEDEITEYLAKKAQKKAMKVAKKLKLQSKDVSGYSNDSNPFGDSNLNEKFVWRKKIEKDVSQGVPLDEFSLKAEKKRQRERKAEIEKVKKRREERAIEKAQREEEMALLARERARAEFQDWEKKEEEFHFDQSKIRSEIRLREGRMKPIDILTKHLDPSDDFEIDINEPYMVFKGLTVKEMEELHNDIKMHLDLDRATPTHIGYWEALLVVSEWELAEARKKDALDRARV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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