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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002192`

染色体: Chr05 坐标: 23409410-23416617 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002192`
名称	SmilChr05G002192
描述	uncharacterized SmilChr05G002192
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	23409410 - 23416617 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986777`
GeneID	`130986777`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986777`
原始查询	`LOC130986777`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827007]; symbol=AT4G13730; hit=AT4G13730; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827007]; symbol=AT4G13730; hit=AT4G13730; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G13730` (AT4G13730) Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827007] identity=66.2; qcov=0.949; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0908100` - identity=68.6; qcov=0.78; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0090630 (activation of GTPase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00566 (RabGAP-TBC); PF23436 (RabGap-TBC_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986777

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766285.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766285.1`
3	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057766285.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057766285.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057766285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:23409567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:23410249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C5
`Chr5:23412956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:23414340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D8
`Chr5:23416098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B133,B69,B9,C15
`Chr5:23416103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B87,B90,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766285.1

449 aa

224

449

RabGAP-TBC

RabGap-TBC_2

PF00566 RabGAP-TBC 224-417 aa PF23436 RabGap-TBC_2 256-429 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766285.1`	Pfam	`PF00566`	RabGAP-TBC	Family	224	417	2.5e-39	135.9	Rab-GTPase-TBC domain
`XP_057766285.1`	Pfam	`PF23436`	RabGap-TBC_2	Domain	256	429	5.9e-08	33.4	RabGAP TBC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910302.1
AAACATGGTCATAGTGGGACGGAGGGAATATTTTTTAGAAAAATAGTATGTATATACATTCCCTGATAAACATTTACAAAATAAATTGTAAAAATTAGTTGTAATTGTGTGTGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTACATAAAAAAAATTAATGACAAAAAATTTGAACCTAAGACTTGAGACCTTAACCATTAGCTATTTGTAATTGTGTTCTTACTTGTTAGTGACTTGAACACAACGGTGCCCTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986777
ATGATGAATAAACGCATCCCCGATTGGCTCAATAGCGCTCTCTGGTCCGCTCCTTCGCCGCATCATGACGCTGCTACCGCCGACCTGCCGCCTCCGGCTCCGCCACCGGCCGCCGAGAGACCGCCGCAGCCGCAGGTGTCCTCTCCTGACGCTCACGACGAACGAGAAGGTAGGGATCCGTTGGGCGGTGTTTCTGAGAATAATGCGAGTCCGTGTTGCAGTGATGAGGAGGATGGCCGCTCATCGGATTATTCCACGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766285.1
MMNKRIPDWLNSALWSAPSPHHDAATADLPPPAPPPAAERPPQPQVSSPDAHDEREGRDPLGGVSENNASPCCSDEEDGRSSDYSTPTAVASPAAKDVTRQNQILNELSRKVINIGEMRRLALQGLPDGAGIRAMVWKVLLGYLPADHSLWSSELAKKRSQYKQFKEELLVNPSEIARRLEESSPENHQLDTGSPRFLSRSEISHGEHPLSLGKTSIWNQFFQETEVVEQINRDVMRTHPDIQFFSGDSTFAKSNQEALR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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