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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002149`

染色体: Chr05 坐标: 22699837-22701625 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002149`
名称	SmilChr05G002149
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	22699837 - 22701625 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986781`
GeneID	`130986781`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986781`
原始查询	`LOC130986781`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
产物	UPF0481 protein At3g47200-like
Arabidopsis	`AT3G50150` (AT3G50150) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824177] identity=33.8; qcov=0.974; evalue=2.93e-71; confidence=low
Rice	`Os05g0242000` - identity=33.4; qcov=1.06; evalue=6.46e-68; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986781

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766290.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057766290.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766290.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766290.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766290.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:22700374`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A16
`Chr5:22700374`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A16
`Chr5:22700421`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B100,B103,B125,B53,B7,C11,C25,C69
`Chr5:22700569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr5:22700570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:22700748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:22700848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr5:22700875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B127
`Chr5:22700875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr5:22700890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr5:22701005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B100,B125,B53,B7,C11,C25,C40,C69
`Chr5:22701072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766290.1

422 aa

211

422

DUF247

PF03140 DUF247 29-405 aa

XP_057766291.1

422 aa

211

422

DUF247

PF03140 DUF247 29-405 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766290.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	29	405	1.5e-119	400.7	Plant protein of unknown function
`XP_057766291.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	29	405	1.5e-119	400.7	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910308.1
TGCTCGTTTCTACATTTATGAACATGACCCCCCCAAAGATATACCAGCTGTATCATTCATTTCGTTCTACATTTATGTCTTGTTAGACTAATTAAAATTCTGGCCGGTGAGATTATGATATGGATCTTGAAAGCACAACGCAAGCCTCCGGTAGGTTGAATGAAAAACTGAAGAAACTCTCCGGGGCAAAATCAGAGTGCACAATCTACAGAGTTCATAGAAATTTACGGAACGTGAATCCCAAGGCTTACGAGCCCGAG...

XM_057910307.1
TCATTCATTTCGTTCTACATTTATGTCTTGTTAGACTAATTAAAATTCTGGCCGGTGAGGTTAGTGAATACTGAATATCTATCAGTTGAAAGACTTGCTATTTCTCTCGTAATTTGTTCGTCCACATCATGTGATTATGATATGGATCTTGAAAGCACAACGCAAGCCTCCGGTAGGTTGAATGAAAAACTGAAGAAACTCTCCGGGGCAAAATCAGAGTGCACAATCTACAGAGTTCATAGAAATTTACGGAACGTGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986781
ATGGATCTTGAAAGCACAACGCAAGCCTCCGGTAGGTTGAATGAAAAACTGAAGAAACTCTCCGGGGCAAAATCAGAGTGCACAATCTACAGAGTTCATAGAAATTTACGGAACGTGAATCCCAAGGCTTACGAGCCCGAGGTGATCGCCATTGGTCCTTATCATCGCAACAAGGATCACCTAAACATGATGGAAGATCACAAGCTACGTTACCTGCAGCAGCTCATCAAAAGGAAACCTTCCAACAATGTCGAAAGCTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766290.1
MDLESTTQASGRLNEKLKKLSGAKSECTIYRVHRNLRNVNPKAYEPEVIAIGPYHRNKDHLNMMEDHKLRYLQQLIKRKPSNNVESYAACVGTLEAEARKCYADQPTGLSSSELIEMLVVDGCFIVELLRKFVMVFERERNDPIFEMDWMTNSLQRDLMLIENQIPFFVLCELFDLIETPGQHSRLRYLLLEFFGSLYPGEGSGGEASVGPREVKHLLHFIHRNWIPCGTGGRKRRDKGLQFINSAARLKEANVRFERSE...

XP_057766291.1
MDLESTTQASGRLNEKLKKLSGAKSECTIYRVHRNLRNVNPKAYEPEVIAIGPYHRNKDHLNMMEDHKLRYLQQLIKRKPSNNVESYAACVGTLEAEARKCYADQPTGLSSSELIEMLVVDGCFIVELLRKFVMVFERERNDPIFEMDWMTNSLQRDLMLIENQIPFFVLCELFDLIETPGQHSRLRYLLLEFFGSLYPGEGSGGEASVGPREVKHLLHFIHRNWIPCGTGGRKRRDKGLQFINSAARLKEANVRFERSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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