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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002179`

染色体: Chr05 坐标: 23228756-23236695 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002179`
名称	SmilChr05G002179
描述	uncharacterized SmilChr05G002179
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	23228756 - 23236695 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986785`
GeneID	`130986785`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986785`
原始查询	`LOC130986785`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P0604E01.25; symbol=P0604E01.25; hit=Os08g0561000; species=rice; confidence=low
产物	P0604E01.25; symbol=P0604E01.25; hit=Os08g0561000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=24.9; qcov=0.941; evalue=2.31e-06; confidence=weak
Rice	`Os08g0561000` (P0604E01.25) - identity=27.6; qcov=0.531; evalue=5.38e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986785

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766296.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766296.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766296.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766296.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766296.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:23228957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C5,C62,C77
`Chr5:23228964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr5:23228974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C4,C42,C66
`Chr5:23228976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B47
`Chr5:23228991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B67
`Chr5:23229026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr5:23229030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr5:23229034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr5:23229051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,C18,C29,C72,D2
`Chr5:23229052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C48
`Chr5:23229067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:23229082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B49

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910313.1
AATCATTTGTTAATTAATACGTAACTAACGTAGTCTTCTTTGAAGCAATTGAATTTTGCGACGAATAAATTAATTGGTTGAAGAAGTTATCTATAAATATAGTCTATAGAGGGTGGAAAACTTGACACACAAACTTGTGACAGCTAAAAAATGGTTTCGAAAAGAAATGTATTTATGGCTGCAGTTTTGGTGCTTCTGATTTCGTCGGAAGCTGCAGACGCCAGAGAACTCACTGAGACGCCCAGTAGAGTGCCATCTAA...

XM_057910315.1
AACTAACGTAGTCTTCTTTGAAGCAATTGAATTTTGCGACGAATAAATTAATTGGTTGAAGAAGTTATCTATAAATATAGTCTATAGAGGGTGGAAAACTTGACACACAAACTTGTGACAGCTAAAAAATGGTTTCGAAAAGAAATGTATTTATGGCTGCAGTTTTGGTGCTTCTGATTTCGTCGGAAGCTGCAGACGCCAGAGAACTCACTGAGACGCCCAGTAGAGTGCCATTTTTGTTGCAGCTAAGGAAGGTGAGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130986785
ATGGATCCACACAACCCTTTCTACGATCCAAATTGGTGCCTCGATCTCTCCTCCGATTATCATCCCGATATGGGAGGAATCAACTTGGAGGAGAGCCCGCCCGAGGAGGAACCGGTCAGTGCACAGCAGAGTGTCTCCCCACCAAAGAAAGGCGGCCGGAGGAAGGAAATGGCCACCAAAATCAAGCACGACAAGGAAGCTAGGTACCGTCATACTTACCTTCCCGAGCATACGGATCTCATCGTCCAAATTTGGGCGGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057766296.1
MDPHNPFYDPNWCLDLSSDYHPDMGGINLEESPPEEEPVSAQQSVSPPKKGGRRKEMATKIKHDKEARYRHTYLPEHTDLIVQIWAEETNDAIRGTDQKGEAYWGRIRARVNPILGVDLKIKQLQGHWSRVSADVRLWEAVWVETRNNWPSGHSDDMLRDKAQILFRARSPHMASFNFWNAWKILRNNPKFKSMYLIGDVHASKRTKTTEEGGFTTSASGEEISSARPIGNKEAKAAAKGKGKASVSHTSSDPPPTIVER...

XP_057766298.1
MDPHNPFYDPNWCLDLSSDYHPDMGGINLEESPPEEEPVSAQQSVSPPKKGGRRKEMATKIKHDKEARYRHTYLPEHTDLIVQIWAEETNDAIRGTDQKGEAYWGRIRARVNPILGVDLKIKQLQGHWSRVSADVRLWEAVWVETRNNWPSGHSDDMLRDKAQILFRARSPHMASFNFWNAWKILRNNPKFKSMYLIGDVHASKRTKTTEEGGFTTSASGEEISSARPIGNKEAKAAAKGKGKASVSHTSSDPPPTIVER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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