当前解析结果
SmilChr05G002148| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002148 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002148 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002148 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 22656765 - 22698986 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986790 |
|---|---|
| GeneID | 130986790 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986790 |
| 原始查询 | LOC130986790 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986790 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057766307.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057766307.1 |
| 3 | Acrosome | Acrosome | 0.40000 | XP_057766308.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057766309.1 |
| 5 | Cell projection | 细胞突起 | 0.40000 | XP_057766308.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:22657320 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 42 | A2,A21,A24,A3,A5,A6,A7,B101,B105,B107,B108,B109,B110,B113,B115,B122,B124,B128,B132,B136,B137,B138,B21,B49,B61,B70,B82,B84,B94,C16,C28,C42,C43,C44,C49,C55,C64,C66,C7,C78,C8,D5 |
Chr5:22667155 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B47 |
Chr5:22667180 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C40,C5 |
Chr5:22690533 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A3,B115 |
Chr5:22690564 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A18,C43 |
Chr5:22690571 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C24,C8 |
Chr5:22690607 |
T |
TTA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D11 |
Chr5:22690607 |
T |
TTA |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:22690609 |
CGT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | D11 |
Chr5:22690609 |
CGT |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:22690624 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | A2,A6,B82,C78 |
Chr5:22690624 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | A2,A6,B82,C78 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA5 records
下载 CDS FASTA5 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。