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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002211`

染色体: Chr05 坐标: 23568531-23570627 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002211`
名称	SmilChr05G002211
描述	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	23568531 - 23570627 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986792`
GeneID	`130986792`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986792`
原始查询	`LOC130986792`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like
产物	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like
Arabidopsis	`AT4G13600` (AT4G13600) Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826993] identity=48.3; qcov=0.916; evalue=2.69e-43; confidence=medium
Rice	`Os03g0756300` (OSJNBb0081K01.7) - identity=50.5; qcov=0.553; evalue=2.19e-31; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986792

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057766313.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057766313.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057766314.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766313.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766313.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:23568753`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr5:23568753`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr5:23568910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B133,B69,B9,C15
`Chr5:23568936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B29
`Chr5:23568950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr5:23569598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr5:23569611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B133,B69,B9,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766313.1

227 aa

114

227

PF07983 X8 22-93 aa

XP_057766314.1

190 aa

190

PF07983 X8 22-93 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766313.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	22	93	4.9e-20	72.7	X8 domain
`XP_057766314.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	22	93	3.9e-20	73.0	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910330.1
TTTTTTGACGAGTGAATCTCGTATGGTATGTGTTGAATTCCTCCAAAACTAAGAAAAGCAATAAAAGCAAAAACACTACATAAAACAAAACAAAAGGGAAATACGAATACCCCATAAACCATAAAGAAAAAGAAACAGCAGCACCACCAATTCCAAAAAAGAAAGCAAAAGGATTATTAAGCACACCTTCATTCTCGATCCTCACCTTTCTTTTTAGCAGCGATGGCCTTCACATTCAAAGCGGTGGCGCTGTTGCTCGC...

XM_057910331.1
CTCGTATGGTATGTGTTGAATTCCTCCAAAACTAAGAAAAGCAATAAAAGCAAAAACACTACATAAAACAAAACAAAAGGGAAATACGAATACCCCATAAACCATAAAGAAAAAGAAACAGCAGCACCACCAATTCCAAAAAAGAAAGCAAAAGGATTATTAAGCACACCTTCATTCTCGATCCTCACCTTTCTTTTTAGCAGCGATGGCCTTCACATTCAAAGCGGTGGCGCTGTTGCTCGCCGCCACCTTCTCCGCGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986792
ATGGCCTTCACATTCAAAGCGGTGGCGCTGTTGCTCGCCGCCACCTTCTCCGCGGCGGCAGGTACGTGGTGCGTGGTGAGGAGCGACGCAACCGAAGTGGCTATGCAAAGAGCTCTGGACTACGCATGCAGCGGCGGCGCCGACTGCGCGCCCATTCAGTCTTCCGGCCTCTGCTATCTTCCCAATACTTTGCCGGCACACGCTTCCTATGCCATCAACAGTTATTACCAGCGCCGGAGGGCCAACGACCCCACCGCCTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766313.1
MAFTFKAVALLLAATFSAAAGTWCVVRSDATEVAMQRALDYACSGGADCAPIQSSGLCYLPNTLPAHASYAINSYYQRRRANDPTACSFAGAAAIAATDPSYGSCVYPSSPSSTVKEKRKAEKEKRKDRFCILTKEHIQPKHFQEYVLYNAGGAVPRPTGTNIPSTMPTLTQPPPPPTAPLYGGGGMGSVVAESPMSNASQTCLLKTSIFYITCVIFLLVFLPNLHL

XP_057766314.1
MAFTFKAVALLLAATFSAAAGTWCVVRSDATEVAMQRALDYACSGGADCAPIQSSGLCYLPNTLPAHASYAINSYYQRRRANDPTACSFAGAAAIAATDPSYGSCVYPSSPSNAGGAVPRPTGTNIPSTMPTLTQPPPPPTAPLYGGGGMGSVVAESPMSNASQTCLLKTSIFYITCVIFLLVFLPNLHL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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