当前解析结果
SmilChr05G002156| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002156 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002156 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002156 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 22769830 - 22773301 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986795 |
|---|---|
| GeneID | 130986795 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986795 |
| 原始查询 | LOC130986795 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0761500; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os02g0761500; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os02g0761500- identity=42.7; qcov=0.77; evalue=2.64e-26; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986795 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057766318.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057766319.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057766318.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766319.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766319.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:22770172 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B42,B43 |
Chr5:22770230 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B121,C4 |
Chr5:22770343 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B26,B61,B8 |
Chr5:22770565 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,B133,C15 |
Chr5:22770566 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B77 |
Chr5:22771737 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 40 | A1,A19,A2,A4,A8,B111,B135,B18,B28,B34,B35,B40,B59,B60,B64,B69,B7,B71,B88,B89,B9,B93,B97,B99,C13,C14,C19,C22,C24,C30,C46,C54,C60,C62,C67,C72,C76,C77,C87,D4 |
Chr5:22771927 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C6 |
Chr5:22772027 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr5:22773154 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr5:22773193 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C53 |
Chr5:22773193 |
T |
TG |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。