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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002205`

染色体: Chr05 坐标: 23518111-23519943 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002205`
名称	SmilChr05G002205
描述	small ubiquitin-related modifier 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	23518111 - 23519943 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986802`
GeneID	`130986802`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986802`
原始查询	`LOC130986802`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	small ubiquitin-related modifier 2-like
产物	small ubiquitin-related modifier 2-like
Arabidopsis	`AT5G55160` (SUMO2) small ubiquitin-like modifier 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835609] identity=37.7; qcov=0.885; evalue=1.36e-16; confidence=low
Rice	`Os01g0918200` - identity=36.7; qcov=0.908; evalue=7.67e-16; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016925 (protein sumoylation); GO:0031386 (protein tag activity); GO:0044389 (ubiquitin-like protein ligase binding)
KEGG	-
Pfam	PF00240 (ubiquitin); PF11976 (Rad60-SLD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986802

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766329.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057766329.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766329.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766329.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766329.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:23519287`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B33
`Chr5:23519287`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B33
`Chr5:23519293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B48,B56,D4
`Chr5:23519316`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B22,B31,B48,B56,B96,C16,C38,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766329.1

87 aa

Rad60-SLD

ubiquitin

PF11976 Rad60-SLD 4-73 aa PF00240 ubiquitin 8-76 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766329.1`	Pfam	`PF11976`	Rad60-SLD	Family	4	73	1.1e-17	64.3	Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like
`XP_057766329.1`	Pfam	`PF00240`	ubiquitin	Domain	8	76	1.3e-09	38.4	Ubiquitin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910346.1
GTTTCCTTTTCCGTTTCTCTCTCTTCCCTCGCAAAAATATTTCTCGCTTTCTGGCATCAACTAACAAATTCATTATTCAAATACACAGCTACAAAAAAATGGACAAAATTTCGGTTGGCGTCAAGTCTCAGGACGGAGACACGATTTTTTTTAAGGTTGCGCCCGAGAAGAAAATACAAGAATTGCTTAAATGTTATTGTGCAGAAAAGAATTTTAAATATAAGGAGTACTCCTTTCTTCACAATGGAACTCGAATCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986802
ATGGACAAAATTTCGGTTGGCGTCAAGTCTCAGGACGGAGACACGATTTTTTTTAAGGTTGCGCCCGAGAAGAAAATACAAGAATTGCTTAAATGTTATTGTGCAGAAAAGAATTTTAAATATAAGGAGTACTCCTTTCTTCACAATGGAACTCGAATCCAACCTACAAAAACTTTCCTTGAGGTTGGCATAGAAGATGGAGACCAGATAGATGTAATGGGGCATCAAGACGGAGGTGGCAACCCAAGGGCTTTTACTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766329.1
MDKISVGVKSQDGDTIFFKVAPEKKIQELLKCYCAEKNFKYKEYSFLHNGTRIQPTKTFLEVGIEDGDQIDVMGHQDGGGNPRAFTT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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