当前解析结果
SmilChr05G002217| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002217 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002217 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002217 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 23663093 - 23664973 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986830 |
|---|---|
| GeneID | 130986830 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986830 |
| 原始查询 | LOC130986830 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986830 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057766336.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057766336.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766336.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766336.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057766336.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:23664220 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C62 |
Chr5:23664372 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B127 |
Chr5:23664425 |
ATG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B102,B23 |
Chr5:23664425 |
ATG |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | B102,B23 |
Chr5:23664525 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B43,C21 |
Chr5:23664544 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B106,C11,C69 |
Chr5:23664549 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C24,D8 |
Chr5:23664553 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C24 |
Chr5:23664566 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C62 |
Chr5:23664573 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B112,B92,C21 |
Chr5:23664588 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D2 |
Chr5:23664611 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B107,B12,B120,C58,C84 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。