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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002783`

染色体: Chr01 坐标: 46280234-46287917 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002783`
名称	SmilChr01G002783
描述	uncharacterized SmilChr01G002783
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46280234 - 46287917 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986837`
GeneID	`130986837`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986837`
原始查询	`LOC130986837`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0595000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os12g0595000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G35730` (AT5G35730) EXS (ERD1/XPR1/SYG1) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833549] identity=77.9; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0595000` - identity=77.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03124 (EXS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986837

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057766345.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057766367.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057766367.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766345.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766345.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46280511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B17,B49,C30
`Chr1:46280535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B17,B49,C30
`Chr1:46280539`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C41
`Chr1:46280539`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C41
`Chr1:46280575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,C43
`Chr1:46284879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:46286180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C45,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766345.1

473 aa

236

473

EXS

PF03124 EXS 107-442 aa

XP_057766355.1

473 aa

236

473

EXS

PF03124 EXS 107-442 aa

XP_057766362.1

473 aa

236

473

EXS

PF03124 EXS 107-442 aa

XP_057766367.1

425 aa

212

425

EXS

PF03124 EXS 59-394 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766345.1`	Pfam	`PF03124`	EXS	Family	107	442	1.7e-93	314.2	EXS family
`XP_057766355.1`	Pfam	`PF03124`	EXS	Family	107	442	1.7e-93	314.2	EXS family
`XP_057766362.1`	Pfam	`PF03124`	EXS	Family	107	442	1.7e-93	314.2	EXS family
`XP_057766367.1`	Pfam	`PF03124`	EXS	Family	59	394	1.2e-93	314.7	EXS family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910362.1
TGAAATCTATAACTACTGAAACACAAGGTTCGTATATAACCGAACTTTATTTTTTCTGTTTAATCTCTGTCTGTACTAAAAAACCCTTACATCAATTCCGCAAATTCATCCGATTGCTTGAGAAATTTTGGTGAAATCTAAGAGGATATAGCACACAGAAGCTGCGCAGATGTTGCAGAATCAGAAGATCTAAGTTTTTTGTTTTGTTTTCTGCAGTTGTGCTTTTAGGGTGCACACTTGATTGTTTAAAACTTGTACCT...

XM_057910379.1
CTGAAACACAAGGTTCGTATATAACCGAACTTTATTTTTTCTGTTTAATCTCTGTCTGTACTAAAAAACCCTTACATCAATTCCGCAAATTCATCCGATTGCTTGAGAAATTTTGGTGAAATCTAAGAGGATATAGCACACAGAAGCTGCGCAGATGTTGCAGAATCAGAAGATCTAAGTTGTGCTTTTAGGGTGCACACTTGATTGTTTAAAACTTGTACCTTTTACCACCTCCATCTATGTTTGGAGGTCTTGAGTCT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130986837
ATGTTTGGAGGTCTTGAGTCTATCCCTAACAATAGTCCTCATCTACGCAAATCTGGTAGTCGGCCTGTTGTGTTTGATATTGGTTCGGGTGAGCTGGGGAATAGCTCCGAGGAAGATTTTTTACATAATACAGAGTCAAATGAAATGAAGGGTGGGACAACACCATTGAGCAGTGCGGCCATTGTGCCTTCCCCTCTTCTGCTTTGGAGATTTAAGGTACTACTGTTTTTCGTCTGGGGATTCTGTTGTTGCAAGATCGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057766345.1
MFGGLESIPNNSPHLRKSGSRPVVFDIGSGELGNSSEEDFLHNTESNEMKGGTTPLSSAAIVPSPLLLWRFKVLLFFVWGFCCCKIGWDSVMRMSADLRDLFLYEAFLYYNPLLLVTMMVWLWGINLWVFAQSNIGYVKIFDLDQSHLTHREIWKCATWMTIIVPTSMTAYLYLYSHGEVSLAASQPVLLYAAVLMTLIFPFDIFYLSSRFFFLRTVWRIVFPLQAISFADFFLADIFTSMSKVFSDLERSVCRMVHRQV...

XP_057766355.1
MFGGLESIPNNSPHLRKSGSRPVVFDIGSGELGNSSEEDFLHNTESNEMKGGTTPLSSAAIVPSPLLLWRFKVLLFFVWGFCCCKIGWDSVMRMSADLRDLFLYEAFLYYNPLLLVTMMVWLWGINLWVFAQSNIGYVKIFDLDQSHLTHREIWKCATWMTIIVPTSMTAYLYLYSHGEVSLAASQPVLLYAAVLMTLIFPFDIFYLSSRFFFLRTVWRIVFPLQAISFADFFLADIFTSMSKVFSDLERSVCRMVHRQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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