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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002765`

染色体: Chr05 坐标: 32033550-32036965 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002765`
名称	SmilChr05G002765
描述	E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1 homolog
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32033550 - 32036965 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986852`
GeneID	`130986852`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986852`
原始查询	`LOC130986852`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1 homolog
产物	E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1 homolog
Arabidopsis	`AT1G53490` (HEI10) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841784] identity=68.6; qcov=1.01; evalue=2.57e-145; confidence=high
Rice	`Os02g0232100` (HEI10) - identity=58.6; qcov=1.04; evalue=9.74e-130; confidence=high
GO	GO:0051026 (chiasma assembly)
KEGG	-
Pfam	PF14634 (zf-RING_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986852

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766371.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057766371.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057766372.1`
4	Centromere	着丝粒	0.20000	`XP_057766371.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057766371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32034928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:32034938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:32035358`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A25,B105,B135,B47,B6,B64,B83,C3,C64,C66,C82,D1
`Chr5:32035363`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A25,B105,B135,B47,B6,B64,B83,C3,C64,C66,C82,D1
`Chr5:32035365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A25,B105,B135,B47,B6,B64,B83,C3,C64,C66,C82,D1
`Chr5:32035649`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	16	A25,A8,B105,B135,B47,B6,B62,B64,B83,C3,C6,C63,C64,C66,C71,C82
`Chr5:32035651`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A25,A8,B105,B135,B47,B6,B62,B64,B83,C3,C6,C63,C64,C66,C71,C82
`Chr5:32035653`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A25,A8,B105,B135,B47,B6,B62,B64,B83,C3,C6,C63,C64,C66,C71,C82
`Chr5:32035659`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A25,A8,B105,B135,B47,B6,B62,B64,B83,C3,C6,C63,C64,C66,C71,C82
`Chr5:32035662`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A25,A8,B105,B135,B47,B6,B62,B64,B83,C3,C6,C63,C66,C71,C82
`Chr5:32035698`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A25,A8,B10,B105,B135,B47,B6,B62,B64,B83,C6,C63,C66,C67,C71,C82,D1
`Chr5:32035860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B110,C60,C62,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766371.1

306 aa

153

306

zf-RING_5

PF14634 zf-RING_5 2-43 aa

XP_057766372.1

296 aa

148

296

zf-RING_5

PF14634 zf-RING_5 2-43 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766371.1`	Pfam	`PF14634`	zf-RING_5	Domain	2	43	2e-07	31.5	zinc-RING finger domain
`XP_057766372.1`	Pfam	`PF14634`	zf-RING_5	Domain	2	43	1.9e-07	31.6	zinc-RING finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910389.1
AATCTCAACGGCTCGCCAAAATTCTTCTCGTCTTTGCCGCGTAATCTGCGATCTCGCTCCAAGTCGATAACCCTGCTTAGTGCTTTGATTTTTCTCTTCGGATTTCGCATTTTCTCTGCGTTTCTGAATTCACCGTCTGTTTCCGGAGTTGAAAGGCGATTTCATTTTATACACGGTTTCACTATCCAATTTCTGCCTCAATCTGGATTCTATTTGGACAACTGCTGAATTCTGTGTCCAAAGCTCGTTTTCGATAGATT...

XM_057910388.1
AATCTCAACGGCTCGCCAAAATTCTTCTCGTCTTTGCCGCGTAATCTGCGATCTCGCTCCAAGTCGATAACCCTGCTTAGTGCTTTGATTTTTCTCTTCGGATTTCGCATTTTCTCTGCGTTTCTGAATTCACCGTCTGTTTCCGGAGTTGAAAGGCGATTTCATTTTATACACGGTTTCACTATCCAATTTCTGCCTCAATCTGGATTCTATTTGGACAACTGCTGAATTCTGTGTCCAAAGCTCGTTTTCGATAGATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986852
ATGAGATGCAATGCTTGCTGGCGGGAGTTGGAAGGGCGAGCCATCGCCACCACCTGTGGTCACGTCTTGTGCACCGAAGATGCCGGTAAGATCCTCAGCAATGATGGTTCATGTCCTATTTGTGATCAAGTGCTCTCTAGAAGTCTTATGAAGCCAATGGACATCAATCCAAATGATGAACAGGCCAATATGGCCATGGTGGGAATATCTCCTCAAACATTAATGAAGTCCTCGTATAGAAGTATAATGTTTTATATTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766371.1
MRCNACWRELEGRAIATTCGHVLCTEDAGKILSNDGSCPICDQVLSRSLMKPMDINPNDEQANMAMVGISPQTLMKSSYRSIMFYIGQRDLEMQVKMKKIVAQYRQKYEEMQEKLTQKVEEAYGAYQKMGKRCQILAQENENLAKDKLELQEKFSEKCRQKRKLDEMYDEARNEIESLKRSAIQPANNFFSRTETDLFSDPARRLDNRDSIRTDWSALTPDTPGPRDDMWSTRRNNSNSTFDMSGGSPAKQSAIPAETGN...

XP_057766372.1
MRCNACWRELEGRAIATTCGHVLCTEDAGKILSNDGSCPICDQVLSRSLMKPMDINPNDEQANMAMVGISPQTLMKSSYRSIMFYIGQRDLEMQVKMKKIVAQYRQKYEEMQEKLTQKVEEAYGAYQKMGKRCQILAQENENLAKDKLELQEKFSEKCRQKRKLDEMYDEARNEIESLKRSAIQPANNFFSRTETDLFSDPARRLDNRDSIRTGPRDDMWSTRRNNSNSTFDMSGGSPAKQSAIPAETGNRVPSSHPSFG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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