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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002770`

染色体: Chr05 坐标: 32218611-32219856 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002770`
名称	SmilChr05G002770
描述	B-box zinc finger protein 22-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32218611 - 32219856 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986853`
GeneID	`130986853`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986853`
原始查询	`LOC130986853`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B-box zinc finger protein 22-like
产物	B-box zinc finger protein 22-like
Arabidopsis	`AT1G78600` (LZF1) light-regulated zinc finger protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844196] identity=45.5; qcov=1.14; evalue=1.56e-71; confidence=high
Rice	`Os06g0152200` (OsBBX16) - identity=51; qcov=0.782; evalue=2.08e-54; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0009640 (photomorphogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF00643 (zf-B_box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986853

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766373.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057766373.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766373.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766373.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766373.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32218835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr5:32219238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B23
`Chr5:32219275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr5:32219299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C31
`Chr5:32219322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr5:32219349`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	B120,B14,B31,B53,B55,B70,B79,B85,C23,C27,C33,C39,C47,C52,C53,C74,C78,C81,C84
`Chr5:32219554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr5:32219589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:32219684`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A23,B119,B124,B133,B137,B15,B24,B53,B61,B64,B75,B98,C19,C28,C31,C34,C43,C49
`Chr5:32219719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr5:32219734`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	104	A16,A22,A23,A4,A5,B1,B101,B107,B108,B109,B110,B112,B115,B119,B120,B124,B125,B128,B13,B133,B134,B137,B139,B14,B15,B20,B21,B24,B25,B31,B32,B38,B39,B4,B41,B47,B48,B53,B54,B55,B58,B6,B60,B61,B63,B64,B65,B68,B69,B7,B70,B75,B79,B8,B85,B9,B91,B95,B98,C10,C11,C12,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C23,C27,C28,C29,C31,C33,C34,C36,C37,C39,C41,C43,C47,C48,C49,C52,C53,C56,C60,C61,C63,C69,C70,C72,C74,C78,C81,C83,C84,C87,D1,D11,D2,D4,D5,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766373.1

243 aa

122

243

zf-B_box

PF00643 zf-B_box 3-47 aa PF00643 zf-B_box 53-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766373.1`	Pfam	`PF00643`	zf-B_box	Domain	3	47	1.8e-13	51.1	B-box zinc finger
`XP_057766373.1`	Pfam	`PF00643`	zf-B_box	Domain	53	95	1.8e-13	51.1	B-box zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910390.1
GATACATTGGTATCTTAGTCTGTGGTTGAGCAATACCCTGAGCTCCTGGCACACCACCCAAGGGGACACTTGTCTTGTCCACACAGGCTTTAACCGACATTTCTCTCTCTTTACCGGATTTAACCGCCACAACACCTCCTTCCTCCTCCCCAACATTCACTAGTCTGCTATTTTGAGGTGAAATGAAGATTCAATGCAACGTGTGTGAGGCGGCGGAGGCGAAAGTGCTGTGCTGCGCCGACGAGGCCGCCCTCTGCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986853
ATGAAGATTCAATGCAACGTGTGTGAGGCGGCGGAGGCGAAAGTGCTGTGCTGCGCCGACGAGGCCGCCCTCTGCACCGAGTGCGACCAGAAAGTGCACGCCGCCAATAAGCTCGCCAGCAAACACCAGAGGGTTCCTCTCTCGACTTGTTCGTCGCAGAAGCCCAAGTGCGATATATGCCAGGAAACAGTAGGGTATTTCTTTTGCTTGGAAGACCGAGCTCTGCTCTGCAGAAGATGTGATGTTTCTGTACACACTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766373.1
MKIQCNVCEAAEAKVLCCADEAALCTECDQKVHAANKLASKHQRVPLSTCSSQKPKCDICQETVGYFFCLEDRALLCRRCDVSVHTANRLVAAHQRFLLTGVKVGLEATKLDPAPPPSTTDLPAQAQGDISSSKTGGSMSQWPLDEFLELGDYTHKYDFMDPTGSSKSEANCGKFGDADWSPVVQVADMELEGDEQNTCFWRVPEIPSPPTASGLYSWSHSAAFVHHRPHGDGPVSDRLVPEL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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