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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002778`

染色体: Chr05 坐标: 32365882-32379240 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002778`
名称	SmilChr05G002778
描述	probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g14840
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32365882 - 32379240 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986866`
GeneID	`130986866`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986866`
原始查询	`LOC130986866`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g14840
产物	probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g14840
Arabidopsis	`AT3G14840` (AT3G14840) Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820713] identity=51.9; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0203400` (SHR5) - identity=41.4; qcov=0.984; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF11721 (Malectin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986866

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766378.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766378.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766378.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766378.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766378.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32367100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr5:32367282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B32,C24,C28,C3
`Chr5:32367448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B32,C24,C28,C3
`Chr5:32367775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,C5,C8,D6
`Chr5:32367820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:32368296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,C11,C35,C69
`Chr5:32368493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:32368648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:32369930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr5:32370277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr5:32371945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:32372530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B40,C58,C62,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766378.1

978 aa

489

978

LRR_1

Malectin

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00560 LRR_1 104-126 aa PF00560 LRR_1 153-174 aa PF11721 Malectin 392-569 aa PF00069 Pkinase 644-846 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 646-913 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766378.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	104	126	1.6e-16	57.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057766378.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	153	174	1.6e-16	57.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057766378.1`	Pfam	`PF11721`	Malectin	Domain	392	569	4.6e-36	125.0	Malectin domain
`XP_057766378.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	644	846	2.9e-44	152.2	Protein kinase domain
`XP_057766378.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	646	913	2.5e-47	162.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910395.1
GCATATTAATTGTTCATGGGTTCTTGATCAGTTTTTCAAATTACAAAACCTTACGACATATATATCGATCTAATATCTATAAGTAATATAATAATGTTGTTGGCATCAAGGTTTATAGCGTTGATTTGGTTTGTGGGGTTTGCTTGTGTAGCAGCTCGTTTACCTGCTCAAGAATTGGAATCATTGTCGGTGGTAGCAAGGAGGCTGGGGAAGAGGGATTGGGATTTCAATGGCGTAGTTGATCCATGCTTAGGGCTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986866
ATGTTGTTGGCATCAAGGTTTATAGCGTTGATTTGGTTTGTGGGGTTTGCTTGTGTAGCAGCTCGTTTACCTGCTCAAGAATTGGAATCATTGTCGGTGGTAGCAAGGAGGCTGGGGAAGAGGGATTGGGATTTCAATGGCGTAGTTGATCCATGCTTAGGGCTGCCTTGGTGGGATAATACTACTAAAGGTGGACTAAATTGCAGCTGCATCCCCTCTGGGAATGTTACTACTTGTCACGTTATCGAGATTATTTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766378.1
MLLASRFIALIWFVGFACVAARLPAQELESLSVVARRLGKRDWDFNGVVDPCLGLPWWDNTTKGGLNCSCIPSGNVTTCHVIEIILKKQNLNGSLPKELVGLPSLQVIDLSRNYLDGILPPEWGSMESLWKIAVLGNRLTGPIPKELAKISALEELVLEANQFTGGIPPEFGDLPRFRKFQLTSNNLTGDLPASLAKLNTLEAFLISDNNFTGSIPNYIQNWSNIKRLEIQASGLSGPIPSNLLFLTNLTDLRISDLNGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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