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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002844`

染色体: Chr05 坐标: 33862136-33877913 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002844`
名称	SmilChr05G002844
描述	protein SEEDLING PLASTID DEVELOPMENT 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	33862136 - 33877913 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986906`
GeneID	`130986906`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986906`
原始查询	`LOC130986906`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SEEDLING PLASTID DEVELOPMENT 1
产物	protein SEEDLING PLASTID DEVELOPMENT 1
Arabidopsis	`AT1G73170` (AT1G73170) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843649] identity=60.5; qcov=0.912; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0155600` - identity=59; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF07728 (AAA_5); PF19568 (Spore_III_AA); PF25516 (PTPase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986906

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057766431.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057766431.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766431.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766431.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766431.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:33862669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:33863598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B137,B45,C31
`Chr5:33863709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr5:33870788`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D5
`Chr5:33870788`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D5
`Chr5:33871887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C71
`Chr5:33874583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C29
`Chr5:33877441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C4,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766431.1

650 aa

325

650

Spore_III_AA

AAA_5

AAA

PTPase

PF19568 Spore_III_AA 167-320 aa PF07728 AAA_5 195-280 aa PF00004 AAA 195-282 aa PF25516 PTPase 443-522 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766431.1`	Pfam	`PF19568`	Spore_III_AA	Family	167	320	3.9e-14	53.3	Sporulation stage III, protein AA
`XP_057766431.1`	Pfam	`PF07728`	AAA_5	Domain	195	280	2.9e-06	28.0	AAA domain (dynein-related subfamily)
`XP_057766431.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	195	282	7.1e-08	33.7	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057766431.1`	Pfam	`PF25516`	PTPase	Domain	443	522	5.7e-26	90.9	Phosphotyrosine protein phosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910448.1
GTGGAGTAATATTTTATTTTTCATAATGCATAAAGCCGAATATGTAGTATTCTTTTGTCCTAATTAAAACTGAAAAAAGACAAGAAAAGTGGTTCGTATCCCAATCAATCCTCTACACAAAACTCGGATAAGCTGGACAACTTTTAGCAACCCCCAAATTCCAATACCTAACCATCCCAAATCCAAATCCCAATCCCATGCTGATTTTACCGCCAAAAAGCCAGTGCTGCTCTCTCCCTCTGCATCTCCCCTTCAAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986906
ATGCTGATTTTACCGCCAAAAAGCCAGTGCTGCTCTCTCCCTCTGCATCTCCCCTTCAAACCCTCTCCAACCCCATACACCCGCTTCCACATTCCCACCACACGAAAACTCTCCTGGCTGGGCTTCAAAGGCCGGAATCTCAGAGTTTCTCCTCTTCTGAACTCATCAGCGCCGCAATTGCCGCCTCATGATGCAACGGGTAGCGCCGAAGAATTCAAAGTGGAACTGGGTCGGCTGCTGGCGCTTTTGCCGGAGGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766431.1
MLILPPKSQCCSLPLHLPFKPSPTPYTRFHIPTTRKLSWLGFKGRNLRVSPLLNSSAPQLPPHDATGSAEEFKVELGRLLALLPEEMRRRVNEHPELHDLIEVIMDLGRKPLARFPSGDFVLSDHPITMEDILHATSQVGDFAVDNRAGISRTLHRISAIRNRKGGIIGLTCRVGRAVSGSAKLLRDLVKDGASLLLIGPPGVGKTTIIRDIARMLANEYEMRVMIVDTSNEIGGDGDIPHSGIGNARRMQVPHTDVQHK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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