当前解析结果
SmilChr05G002833| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002833 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002833 |
| 描述 | ATG8-interacting protein 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 33666258 - 33670462 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986917 |
|---|---|
| GeneID | 130986917 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986917 |
| 原始查询 | LOC130986917 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ATG8-interacting protein 1-like |
| 产物 | ATG8-interacting protein 1-like |
| Arabidopsis | AT2G45980 (ATI1)mesoderm induction early response protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819206] identity=45.6; qcov=1.01; evalue=2.51e-68; confidence=high |
| Rice | Os04g0165300- identity=33.7; qcov=1.01; evalue=3.53e-30; confidence=low |
| GO | GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986917 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057766451.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.60000 | XP_057766451.1 |
| 3 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.60000 | XP_057766460.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057766451.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057766451.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:33668570 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr5:33668619 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,B77 |
Chr5:33668641 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B31 |
Chr5:33668975 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr5:33669076 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr5:33669215 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B127,B74,B77,C74,D2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
12 records
下载 cDNA FASTA12 records
下载 CDS FASTA12 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。