当前解析结果
SmilChr05G002828| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002828 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002828 |
| 描述 | amino-acid permease BAT1 homolog |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 33546649 - 33547371 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986925 |
|---|---|
| GeneID | 130986925 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986925 |
| 原始查询 | LOC130986925 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | amino-acid permease BAT1 homolog |
| 产物 | amino-acid permease BAT1 homolog |
| Arabidopsis | AT2G01170 (BAT1)bidirectional amino acid transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814645] identity=78.3; qcov=0.968; evalue=4.47e-47; confidence=medium |
| Rice | Os01g0607200 (OsBAT1)- identity=80.4; qcov=0.968; evalue=1.11e-46; confidence=medium |
| GO | GO:0005313 (L-glutamate transmembrane transporter activity); GO:0015180 (L-alanine transmembrane transporter activity); GO:0015185 (gamma-aminobutyric acid transmembrane transporter activity); GO:0015189 (L-lysine transmembrane transporter activity); GO:0015812 (gamma-aminobutyric acid transport); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF13520 (AA_permease_2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986925 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057766477.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.40000 | XP_057766477.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057766477.1 |
| 4 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057766477.1 |
| 5 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.20000 | XP_057766477.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057766477.1PF13520
AA_permease_2 2-84 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057766477.1 |
Pfam | PF13520 |
AA_permease_2 | Family | 2 | 84 | 5.1e-15 | 56.0 | Amino acid permease |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。