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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002879`

染色体: Chr05 坐标: 34464165-34467907 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002879`
名称	SmilChr05G002879
描述	homeobox-leucine zipper protein PROTODERMAL FACTOR 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	34464165 - 34467907 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986950`
GeneID	`130986950`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986950`
原始查询	`LOC130986950`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox-leucine zipper protein PROTODERMAL FACTOR 2-like
产物	homeobox-leucine zipper protein PROTODERMAL FACTOR 2-like
Arabidopsis	`AT4G04890` (PDF2) protodermal factor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825828] identity=36.6; qcov=0.633; evalue=2e-58; confidence=medium
Rice	`Os08g0187500` (Roc1(t)) - identity=37.8; qcov=0.613; evalue=2.8e-58; confidence=medium
GO	GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF01852 (START); PF25797 (PDF2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986950

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766486.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057766486.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057766486.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766486.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766486.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:34464414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr5:34464425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A23,C43,C76
`Chr5:34464436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,D11
`Chr5:34464461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C62
`Chr5:34464545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B17,C4
`Chr5:34464546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:34464585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:34464718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr5:34464871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:34464890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,C60,C62,C82
`Chr5:34465197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C43,C76
`Chr5:34465313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766486.1

576 aa

288

576

START

PDF2_C

PF01852 START 158-330 aa PF25797 PDF2_C 350-572 aa

XP_057766487.1

509 aa

254

509

PDF2_C

PF25797 PDF2_C 283-505 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766486.1`	Pfam	`PF01852`	START	Domain	158	330	5.3e-21	75.7	START domain
`XP_057766486.1`	Pfam	`PF25797`	PDF2_C	Domain	350	572	1.3e-54	185.6	PDF2-like, C-terminal domain
`XP_057766487.1`	Pfam	`PF25797`	PDF2_C	Domain	283	505	9.7e-55	186.0	PDF2-like, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910504.1
GTAATCTTACCTACAAATCCATAGAAAATTTTGATGTTCACGAAATGAAATAGGATTGTTTTTCTTTTTCATTTTTTTGTGCACGCGTGAAAATCTAGATCCAGTGTGTGTGTGTGTTTTATGATTATTAATATTTTCAGGTGCACTTAGTTTTCACGGATACTATTTTGGTGGCTCCAGGATATAAAGATGGCGGTGTGTGACAAATTAGGATTGAAGCACAACATGATTAATGATTACGATGGCCAGTATGTAAGCAA...

XM_057910503.1
TAATCTTACCTACAAATCCATAGAAAATTTTGATGTTCACGAAATGAAATAGGATTGTTTTTCTTTTTCATTTTTTTGTGCACGCGTGAAAATCTAGATCCAGTGTGTGTGTGTGTTTTATGATTATTAATATTTTCAGGTGCACTTAGTTTTCACGGATACTATTTTGGTGGCTCCAGGATATAAAGATGGCGGTGTGTGACAAATTAGGATTGAAGCACAACATGATTAATGATTACGATGGCCAGTATGTAAGCAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986950
ATGGCGGTGTGTGACAAATTAGGATTGAAGCACAACATGATTAATGATTACGATGGCCAGTATGTAAGCAATAGAGAAGCAGCAACAGCTGCTGATGACTGTATGCACCCAAGCTTTTCAATGCCTAATGCTTACTGCAGAGCCGATGTACATTTCCAGTCCTTGCATGATTACTCGAATAATATGCAACGGGCGAGTGATCTCCTCGTTGCAGTCTCATCGAGTGCTGAGGTACACAAGGAAAGAATTCTTGATCTTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766486.1
MAVCDKLGLKHNMINDYDGQYVSNREAATAADDCMHPSFSMPNAYCRADVHFQSLHDYSNNMQRASDLLVAVSSSAEVHKERILDLAFSASEELRIVAQEQQSLWLFDIDNGCEVLNQAEYKRRFESFDPNLEEVIRLISGGKPYDLPDLNENIESCTTQKMNSESSRANGVVFREPVWLVSMFMDVDKWSAAFSNVVSKAINLAVLNTGNKEIANGCVQVMYAEFHNCSPLIKPRQMYFVRQSRQIDANTWVVADISLE...

XP_057766487.1
MAVCDKLGLKHNMINDYDGQYVSNREAATAADDCMHPSFSMPNAYCRADVHFQSLHDYSNNMQRASDLLVAVSSSAEVHKERILDLAFSASEELRIVAQEQQSLWLFDIDNGCEVLNQAEYKRRFESFDPNLEEVIRLISGGKPYDLPDLNENIESCTTQKMNSESSRANGVVFREPVWLVSMFMDVDKWSAAFSNVVSKAINLAVLNTGNKEIANGCVQVVTWVEHNAECNGFAHSMFKGLLESGVVYNAKRWMSTLER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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