当前解析结果
SmilChr05G002905| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002905 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002905 |
| 描述 | kinesin-like protein KIN-14N |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 34890879 - 34896237 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986972 |
|---|---|
| GeneID | 130986972 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986972 |
| 原始查询 | LOC130986972 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | kinesin-like protein KIN-14N |
| 产物 | kinesin-like protein KIN-14N |
| Arabidopsis | AT4G21270 (ATK1)kinesin 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827876] identity=61.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os07g0105700 (OsDLK)- identity=58; qcov=0.901; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0003777 (microtubule motor activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0007018 (microtubule-based movement); GO:0008017 (microtubule binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00225 (Kinesin); PF16796 (Microtub_bd) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986972 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 1.00000 | XP_057766506.1 |
| 2 | Spindle | Spindle | 1.00000 | XP_057766506.1 |
| 3 | Midbody | Midbody | 1.00000 | XP_057766506.1 |
| 4 | Centrosome | 中心体 | 0.80000 | XP_057766506.1 |
| 5 | Spindle pole | Spindle pole | 0.80000 | XP_057766506.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:34891158 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,B140 |
Chr5:34891653 |
C |
CAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 5 | A14,A3,B137,B56,C17 |
Chr5:34891653 |
C |
CAA |
2bp_insertion | CDS_variant | 5 | A14,A3,B137,B56,C17 |
Chr5:34891821 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,C42,D8 |
Chr5:34892050 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A1,C42,C85,D8 |
Chr5:34892280 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B112,B40,B91 |
Chr5:34892361 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,C42,D8 |
Chr5:34892969 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr5:34892983 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B38 |
Chr5:34893059 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B69,B9,C5 |
Chr5:34893242 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,A3,B23,C71,C74 |
Chr5:34893441 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A18,A23,C43,C76 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057766506.1PF16796
Microtub_bd 424-589 aa
PF00225
Kinesin 448-778 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057766506.1 |
Pfam | PF16796 |
Microtub_bd | Domain | 424 | 589 | 8.2e-53 | 179.2 | Microtubule binding |
XP_057766506.1 |
Pfam | PF00225 |
Kinesin | Domain | 448 | 778 | 7.6e-111 | 370.9 | Kinesin motor domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。