当前解析结果
SmilChr05G002909| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002909 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002909 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002909 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 34952416 - 34953347 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986977 |
|---|---|
| GeneID | 130986977 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986977 |
| 原始查询 | LOC130986977 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986977 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057766511.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057766511.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057766511.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766511.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057766511.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:34952629 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:34952661 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A24,C69 |
Chr5:34952704 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 45 | A10,A14,A7,B105,B106,B109,B114,B123,B132,B137,B2,B28,B31,B34,B36,B5,B60,B67,B71,B72,B73,B76,B78,B79,B80,C1,C13,C14,C16,C27,C30,C34,C41,C46,C47,C5,C52,C57,C59,C64,C66,C83,C87,C9,D9 |
Chr5:34952708 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 45 | A10,A14,A7,B105,B106,B109,B114,B123,B132,B137,B2,B28,B31,B34,B36,B5,B60,B67,B71,B72,B73,B76,B78,B79,B80,C1,C13,C14,C16,C27,C30,C34,C41,C46,C47,C5,C52,C57,C59,C64,C66,C83,C87,C9,D9 |
Chr5:34952709 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,C73,C74,D6 |
Chr5:34952710 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 45 | A10,A14,A7,B105,B106,B109,B114,B123,B132,B137,B2,B28,B31,B34,B36,B5,B60,B67,B71,B72,B73,B76,B78,B79,B80,C1,C13,C14,C16,C27,C30,C34,C41,C46,C47,C5,C52,C57,C59,C64,C66,C83,C87,C9,D9 |
Chr5:34952711 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 45 | A10,A14,A7,B105,B106,B109,B114,B123,B132,B137,B2,B28,B31,B34,B36,B5,B60,B67,B71,B72,B73,B76,B78,B79,B80,C1,C13,C14,C16,C27,C30,C34,C41,C46,C47,C5,C52,C57,C59,C64,C66,C83,C87,C9,D9 |
Chr5:34952769 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C64 |
Chr5:34952783 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B75,C10,C64 |
Chr5:34952796 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A22,B134 |
Chr5:34952800 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D1 |
Chr5:34952806 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,C73,C74,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。