当前解析结果
SmilChr05G002908| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002908 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002908 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002908 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 34950720 - 34952245 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986979 |
|---|---|
| GeneID | 130986979 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986979 |
| 原始查询 | LOC130986979 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986979 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057766512.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057766512.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766512.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766512.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057766512.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:34951720 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr5:34951721 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C86 |
Chr5:34951732 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C16 |
Chr5:34951736 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B12,B66,C47 |
Chr5:34951746 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B67,C15 |
Chr5:34951771 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B12,B66,C47 |
Chr5:34951777 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B12,B66,C47 |
Chr5:34951857 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
Chr5:34951875 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,A3,C74,D6 |
Chr5:34951900 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A13,B139,C4 |
Chr5:34951917 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C22 |
Chr5:34952002 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B124 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。