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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002911`

染色体: Chr05 坐标: 35080957-35081823 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002911`
名称	SmilChr05G002911
描述	elongation factor 1-delta-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35080957 - 35081823 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986981`
GeneID	`130986981`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986981`
原始查询	`LOC130986981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	elongation factor 1-delta-like
产物	elongation factor 1-delta-like
Arabidopsis	`AT2G18110` (AT2G18110) Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816323] identity=74.5; qcov=0.991; evalue=8.8e-104; confidence=high
Rice	`Os07g0614500` (eEF-1beta) - identity=70.3; qcov=1.03; evalue=5.17e-91; confidence=high
GO	GO:0003746 (translation elongation factor activity); GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0005853 (eukaryotic translation elongation factor 1 complex); GO:0006414 (translational elongation)
KEGG	-
Pfam	PF00736 (EF1_GNE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986981

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766514.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766514.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766514.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766514.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766514.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35081016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:35081022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:35081048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,C60,C62,C82
`Chr5:35081169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,C22,C60,C62,C82
`Chr5:35081201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr5:35081208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,C22,C60,C62,C82
`Chr5:35081255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A3,C74,D6
`Chr5:35081257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr5:35081258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:35081349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B31,C71,D11
`Chr5:35081356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr5:35081398`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A18,A23,C43,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766514.1

226 aa

113

226

EF1_GNE

PF00736 EF1_GNE 140-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766514.1`	Pfam	`PF00736`	EF1_GNE	Domain	140	226	1.2e-31	109.3	EF-1 guanine nucleotide exchange domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910531.1
CCAAATCTCATCTTCATCAAGAAATGGCCGTCAGTTTCTCCGACCTCAAGAAGCTCGATGAGTACCTTCTTACTCGCAGTTACATTACTGGGTACCAAGCTTCAAAAGATGATTTGACTGTTTATGCTACTCTCGCCAAGCCTCCATCATCGGACTACGTTAATGTGTCACGGTGGTTCAACCACATCGATGCACTGTTGAGGATTTCTGGTGTTTCTGGTGAGGGAAGTGGTGTAACTGTTGAGGGATCAGCTCTTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986981
ATGGCCGTCAGTTTCTCCGACCTCAAGAAGCTCGATGAGTACCTTCTTACTCGCAGTTACATTACTGGGTACCAAGCTTCAAAAGATGATTTGACTGTTTATGCTACTCTCGCCAAGCCTCCATCATCGGACTACGTTAATGTGTCACGGTGGTTCAACCACATCGATGCACTGTTGAGGATTTCTGGTGTTTCTGGTGAGGGAAGTGGTGTAACTGTTGAGGGATCAGCTCTTGTCAGTGATGCTATTGCAACTCCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766514.1
MAVSFSDLKKLDEYLLTRSYITGYQASKDDLTVYATLAKPPSSDYVNVSRWFNHIDALLRISGVSGEGSGVTVEGSALVSDAIATPPAIDTKAVAADDDDDDDDVDLFGEETEEDKKASEERAAAAKAAGKKKVVGKSSIVLDIKPWDDETDMKKLEEEVRKVQQEGLLWGASKLVPVGYGIKKLQIMITIGDDLVSVDNLIEDHLTAEPLNEYVQSVDIVAFNKI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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