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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002957`

染色体: Chr05 坐标: 35751347-35753820 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002957`
名称	SmilChr05G002957
描述	PRA1 family protein H
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35751347 - 35753820 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987017`
GeneID	`130987017`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987017`
原始查询	`LOC130987017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PRA1 family protein H
产物	PRA1 family protein H
Arabidopsis	`AT4G27540` (PRA1.H) prenylated RAB acceptor 1.H [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828863] identity=55.5; qcov=0.891; evalue=9.3e-86; confidence=high
Rice	`Os09g0134400` - identity=36.8; qcov=0.865; evalue=5.64e-38; confidence=medium
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF03208 (PRA1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987017

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057766559.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057766559.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057766559.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057766560.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766559.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35751633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:35751641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:35751646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,C58,C62
`Chr5:35751708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B102,B42,B43
`Chr5:35751819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B67,B97,C19,C52
`Chr5:35751885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B33,B46,C75,C9
`Chr5:35751933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:35752150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:35752236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B22,B65
`Chr5:35752256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:35752291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B22,B36,D5
`Chr5:35752358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766559.1

268 aa

134

268

PRA1

PF03208 PRA1 124-190 aa

XP_057766560.1

267 aa

134

267

PRA1

PF03208 PRA1 124-246 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766559.1`	Pfam	`PF03208`	PRA1	Family	124	190	7.7e-10	39.2	PRA1 family protein
`XP_057766560.1`	Pfam	`PF03208`	PRA1	Family	124	246	3e-16	60.0	PRA1 family protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910577.1
CCTTTATAGAATTAAAAATAGGAAAAAAATAACCCTTAGACGACATAGTTGTGGAGACGAGCAGGCGAGGCCCAGGCAAGGGAATAACCGTAGAGGTAGAGTAGCCTTATCCGGGCGGTACAAAATGAAACGATGCCCAACATAAAATTAGCATTCTTCCCCACAAAGCAGCACGCACTAAACACGAAACAGATGTTTGACCCGAACCCGTTATCTCTAAGTGTTCCCGAACCCGAATTCGAATCATGGCTCCGCGACTC...

XM_057910576.1
ACGACATAGTTGTGGAGACGAGCAGGCGAGGCCCAGGCAAGGGAATAACCGTAGAGGTAGAGTAGCCTTATCCGGGCGGTACAAAATGAAACGATGCCCAACATAAAATTAGCATTCTTCCCCACAAAGCAGCACGCACTAAACACGAAACAGATGTTTGACCCGAACCCGTTATCTCTAAGTGTTCCCGAACCCGAATTCGAATCATGGCTCCGCGACTCCGGCTACCTCGAAATCGTTGACCAGCGTTCCACCGACCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987017
ATGCCCAACATAAAATTAGCATTCTTCCCCACAAAGCAGCACGCACTAAACACGAAACAGATGTTTGACCCGAACCCGTTATCTCTAAGTGTTCCCGAACCCGAATTCGAATCATGGCTCCGCGACTCCGGCTACCTCGAAATCGTTGACCAGCGTTCCACCGACCTCCACCGCCTCTCCACCGCCGCCAAGCCCTCTAATTCCGCCGCCGCCGACTCAGCCACCACTTCGATTAGTACCAACGGAGTATTCCTCGTCTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766559.1
MPNIKLAFFPTKQHALNTKQMFDPNPLSLSVPEPEFESWLRDSGYLEIVDQRSTDLHRLSTAAKPSNSAAADSATTSISTNGVFLVSRFFSRVWTLLSLLTFNPLSKLAASDFSGDTPSWTLAFFGSSESYSFPSSRSQARLRVRENVKRFARNYTTLFVLFFACSLYQLPIALFGLLSCLALWDAFKLSGDRWGLDRYPLLRQALIRTAQCCELICLLRIFFASMAYLNKKLDGYIMFLFTISIPSIVQKILQDNVGVH...

XP_057766560.1
MPNIKLAFFPTKQHALNTKQMFDPNPLSLSVPEPEFESWLRDSGYLEIVDQRSTDLHRLSTAAKPSNSAAADSATTSISTNGVFLVSRFFSRVWTLLSLLTFNPLSKLAASDFSGDTPSWTLAFFGSSESYSFPSSRSQARLRVRENVKRFARNYTTLFVLFFACSLYQLPIALFGLLSCLALWDAFKLSGDRWGLDRYPLLRQALIRTAQCLAGVILFISNVQFAIFCATGVSFAVMILHASFRKLTPAKQPDQRGGYR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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