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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003573`

染色体: Chr05 坐标: 47731671-47734005 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003573`
名称	SmilChr05G003573
描述	iron-sulfur assembly protein IscA-like 2, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47731671 - 47734005 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987071`
GeneID	`130987071`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987071`
原始查询	`LOC130987071`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	iron-sulfur assembly protein IscA-like 2, mitochondrial
产物	iron-sulfur assembly protein IscA-like 2%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G03905` (AT5G03905) Iron-sulfur cluster biosynthesis family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830270] identity=65.8; qcov=1; evalue=4.35e-35; confidence=medium
Rice	`Os08g0369700` (OsISC10) - identity=70.4; qcov=1.02; evalue=1.33e-35; confidence=medium
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding); GO:0051539 (4 iron, 4 sulfur cluster binding); GO:0106035 (GO:0106035)
KEGG	-
Pfam	PF01521 (Fe-S_biosyn)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987071

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766638.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057766638.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766639.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766639.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766639.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47733745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr5:47733766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C84
`Chr5:47733794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:47733965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr5:47733967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766638.1

90 aa

Fe-S_biosyn

PF01521 Fe-S_biosyn 16-89 aa

XP_057766639.1

88 aa

Fe-S_biosyn

PF01521 Fe-S_biosyn 14-87 aa

XP_057766641.1

79 aa

Fe-S_biosyn

PF01521 Fe-S_biosyn 5-78 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766638.1`	Pfam	`PF01521`	Fe-S_biosyn	Domain	16	89	1.1e-08	36.0	Iron-sulphur cluster biosynthesis
`XP_057766639.1`	Pfam	`PF01521`	Fe-S_biosyn	Domain	14	87	1e-08	36.1	Iron-sulphur cluster biosynthesis
`XP_057766641.1`	Pfam	`PF01521`	Fe-S_biosyn	Domain	5	78	7.2e-09	36.5	Iron-sulphur cluster biosynthesis

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910656.1
TCACACGAATTCATTCGTGAAAGCTAATATTCCGTCCTCCTCCAACTATTCCTTTCTTCTCCGCGCTGCCGTTCGTCCGCCCACCGTTGTTCATCCGCCCGCCGTCGTTTCTCCGCCGCCGGCATCCTTTTCTTCGCGCACGGCGGTGAAGCCCTAAAATCCCTAAATCCCCAAATTCTTCCTCCCACCTAAAATCCCTAAAATTGAAATCCCCAAATCGATGAAGATTTTCCTGAGGTTTGGCCAGTCCGCCATGCCTT...

XM_057910658.1
TCACACGAATTCATTCGTGAAAGCTAATATTCCGTCCTCCTCCAACTATTCCTTTCTTCTCCGCGCTGCCGTTCGTCCGCCCACCGTTGTTCATCCGCCCGCCGTCGTTTCTCCGCCGCCGGCATCCTTTTCTTCGCGCACGGCGGTGAAGCCCTAAAATCCCTAAATCCCCAAATTCTTCCTCCCACCTAAAATCCCTAAAATTGAAATCCCCAAATCGATGAAGATTTTCCTGAGGTTTGGCCAGTCCGCCATGCCTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130987071
ATGAAGACCTGTGGTTTCACTGCTGTGTCCTCTCGAATGAAAGAGTTGCAAGCTGAAGAGTCCAGTAAGAAGTTGCTGCGCTTGAGCATAGAAGCTGGTGGTTGCTCTGGGTTTCAGTATAACTTTTCACTTGATGATAAGACCAATAATGATGACAGGATCTTTGAGCAGGATGGAGTTAAATTGGTGGGTGATAATATTTCATTTGACTTTGTGAAAGGGGCAACTGTTTATTATGTTGACGAGCTTATCCGCTTTGC...

LOC130987071
ATGAAGCGAATGAAAGAGTTGCAAGCTGAAGAGTCCAGTAAGAAGTTGCTGCGCTTGAGCATAGAAGCTGGTGGTTGCTCTGGGTTTCAGTATAACTTTTCACTTGATGATAAGACCAATAATGATGACAGGATCTTTGAGCAGGATGGAGTTAAATTGGTGGGTGATAATATTTCATTTGACTTTGTGAAAGGGGCAACTGTTTATTATGTTGACGAGCTTATCCGCTTTGCCTTTTAG

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057766638.1
MIMQTCGFTAVSSRMKELQAEESSKKLLRLSIEAGGCSGFQYNFSLDDKTNNDDRIFEQDGVKLVGDNISFDFVKGATVYYVDELIRFAF

XP_057766639.1
MKTCGFTAVSSRMKELQAEESSKKLLRLSIEAGGCSGFQYNFSLDDKTNNDDRIFEQDGVKLVGDNISFDFVKGATVYYVDELIRFAF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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