当前解析结果
SmilChr05G003577| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003577 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003577 |
| 描述 | cadmium-induced protein AS8-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 47773764 - 47775926 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987074 |
|---|---|
| GeneID | 130987074 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987074 |
| 原始查询 | LOC130987074 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cadmium-induced protein AS8-like |
| 产物 | cadmium-induced protein AS8-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987074 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057766649.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057766649.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 1.00000 | XP_057766649.1 |
| 4 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057766645.1 |
| 5 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.60000 | XP_057766645.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:47774657 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 18 | A11,B101,B115,B121,B21,B29,B32,B40,B44,B54,B73,B89,C26,C36,C48,C77,C87,D8 |
Chr5:47775205 |
G |
GGT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | C18,C29 |
Chr5:47775205 |
G |
GGT |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | C18,C29 |
Chr5:47775376 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C1,C43,C76,D4 |
Chr5:47775404 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A18,C1,C43,C76 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
10 records
下载 cDNA FASTA10 records
下载 CDS FASTA10 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。