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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003583`

染色体: Chr05 坐标: 47866248-47869132 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003583`
名称	SmilChr05G003583
描述	receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-7
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47866248 - 47869132 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987081`
GeneID	`130987081`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987081`
原始查询	`LOC130987081`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-7
产物	receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-7
Arabidopsis	`AT1G67520` (AT1G67520) lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843073] identity=39.6; qcov=1.04; evalue=4.88e-145; confidence=medium
Rice	`Os01g0783800` - identity=53.1; qcov=0.589; evalue=1.65e-134; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0048544 (recognition of pollen)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00954 (S_locus_glycop); PF01453 (B_lectin); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF11883 (DUF3403)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987081

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766658.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766658.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766658.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766658.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766658.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47866440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr5:47866562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,C82,D1
`Chr5:47866572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,A3,B54,B87,D9
`Chr5:47866669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C12,C3,C8
`Chr5:47866984`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	71	A20,A22,A23,A3,A4,A6,B104,B11,B117,B12,B120,B126,B131,B134,B137,B138,B140,B15,B22,B28,B33,B34,B46,B5,B53,B54,B60,B64,B67,B69,B74,B79,B8,B82,B83,B85,B87,B91,C1,C10,C11,C12,C15,C18,C19,C2,C20,C22,C3,C30,C31,C37,C42,C43,C50,C52,C58,C6,C64,C66,C69,C76,C8,C82,C83,C84,D1,D11,D6,D7,D9
`Chr5:47866986`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	68	A20,A22,A23,A3,A4,A6,B104,B11,B117,B12,B120,B126,B131,B134,B137,B138,B140,B15,B28,B34,B46,B5,B53,B54,B60,B64,B67,B74,B79,B8,B82,B83,B85,B87,B91,C1,C10,C11,C12,C15,C18,C19,C2,C20,C22,C3,C30,C31,C37,C42,C43,C50,C52,C58,C6,C64,C66,C69,C76,C8,C82,C83,C84,D1,D11,D6,D7,D9
`Chr5:47867224`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A2,A21,A7,B10,B125,B13,B22,B33,B34,B42,B43,B47,B51,B52,B58,B65,B69,B75,B9,C13,C5,C56,C65,C76,C83,D10,D6
`Chr5:47867244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:47867714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B48,B66,B98,C61
`Chr5:47867843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C85
`Chr5:47867845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C41
`Chr5:47867851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766658.1

694 aa

347

694

B_lectin

S_locus_glycop

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

DUF3403

PF01453 B_lectin 78-176 aa PF00954 S_locus_glycop 210-296 aa PF00069 Pkinase 384-585 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 385-652 aa PF11883 DUF3403 654-694 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766658.1`	Pfam	`PF01453`	B_lectin	Repeat	78	176	3.6e-25	89.2	D-mannose binding lectin
`XP_057766658.1`	Pfam	`PF00954`	S_locus_glycop	Domain	210	296	1.2e-09	39.4	S-locus glycoprotein domain
`XP_057766658.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	384	585	8e-44	150.7	Protein kinase domain
`XP_057766658.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	385	652	1.4e-47	163.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057766658.1`	Pfam	`PF11883`	DUF3403	Family	654	694	5.8e-09	36.6	Domain of unknown function (DUF3403)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910675.1
TTCATGAGCTTTTATTATCTGGTTTCACAAAAGTTATTTCAGTAAAACAAGTTTTTTTCTTTACTAATAACACCTATCATTTCTTGGATCTGCTGTGCAAGTATCAATTATCAGATCAAACATGTTGAGAATCACAAATGATGGAAACCTAGTAATCTCAGCATGTTTACTGCTATGTTTAATGGCACAAAACCCATGCCCTTCCATTGGAACAGACACACTTTCCAAAGGAGATTACATCACAGAGAGCCACACCTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987081
ATGTTGAGAATCACAAATGATGGAAACCTAGTAATCTCAGCATGTTTACTGCTATGTTTAATGGCACAAAACCCATGCCCTTCCATTGGAACAGACACACTTTCCAAAGGAGATTACATCACAGAGAGCCACACCTTAATCTCAAAAGATGGCATCTTTGAACTGGGATTCTTCACTACTTCCTCACACAACACCTATTTAGGCATTTGGTACAAAGATTTTCCAAACAAAACTGTAGTTTGGGTGGCTAACAGAGAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766658.1
MLRITNDGNLVISACLLLCLMAQNPCPSIGTDTLSKGDYITESHTLISKDGIFELGFFTTSSHNTYLGIWYKDFPNKTVVWVANREHPLPNTSGLKQLKLAPNGNLELYHDLDPFWSTSLIPTLPETVEAVLLDDGNLILRDGSKPGRIFWQSFDHPTDAWLAGAGLGRRQRLVSWKSTDDPSPGPFSMEMSSEKPHSFFLMWKMSTVYWRSGDWNVSVFSSVPELSYLYNFSFPANEYGTYIRYSVLNPAVFSMVVLDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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