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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr05G003587

染色体: Chr05 坐标: 47919834-47926052 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr05G003587
名称SmilChr05G003587
描述cyclin-dependent kinase F-4-like
染色体 / SeqIDChr05 / NC_080391.1
坐标与链方向47919834 - 47926052 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130987084
GeneID130987084
locus_tag-
NCBI NameLOC130987084
原始查询LOC130987084

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述cyclin-dependent kinase F-4-like
产物cyclin-dependent kinase F-4-like
ArabidopsisAT4G19110 (AT4G19110)
Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827649]
identity=65.45; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
RiceOs02g0700600 (CDKF)
-
identity=59.21; qcov=0.978; evalue=0.0; confidence=high
GOGO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0035556 (intracellular signal transduction)
KEGG-
PfamPF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130987084

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五折投票；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，投票比例不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。

Rank定位位置中文五折投票比例Protein ID
1 Cytoplasm 细胞质 1.00000 XP_057766661.1
2 Nucleus 细胞核 0.80000 XP_057766661.1
3 Cytosol 细胞质基质 0.80000 XP_057766661.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr5:47920035 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B48,B75,C9
Chr5:47920110 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B24,B80
Chr5:47920141 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B11,B131,B46,B53
Chr5:47920161 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B11,B131,B46,B53
Chr5:47920171 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B91,C11,C69
Chr5:47920559 T TA 1bp_insertion frameshift_variant 1 C4
Chr5:47920559 T TA 1bp_insertion CDS_variant 1 C4
Chr5:47921639 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B138,C64,C66,D2
Chr5:47922296 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B48
Chr5:47923307 G A EMS_canonical_SNV stop_gained 3 B91,C11,C69
Chr5:47923307 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B91,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766661.1
455 aa
N
1
228
455
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 4-287 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-199 aa
XP_057766662.1
455 aa
N
1
228
455
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 4-287 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-199 aa
XP_057766663.1
455 aa
N
1
228
455
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 4-287 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-199 aa
XP_057766664.1
455 aa
N
1
228
455
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 4-287 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-199 aa
XP_057766665.1
451 aa
N
1
226
451
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 4-283 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-195 aa
XP_057766666.1
451 aa
N
1
226
451
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 4-283 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-195 aa
XP_057766667.1
451 aa
N
1
226
451
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 4-283 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-195 aa
XP_057766668.1
451 aa
N
1
226
451
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 4-283 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-195 aa
XP_057766669.1
451 aa
N
1
226
451
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 4-283 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-195 aa
XP_057766670.1
451 aa
N
1
226
451
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 4-283 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 5-195 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057766661.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 4 287 1.3e-68 232.0 Protein kinase domain
XP_057766661.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 5 199 3.1e-36 125.7 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057766662.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 4 287 1.3e-68 232.0 Protein kinase domain
XP_057766662.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 5 199 3.1e-36 125.7 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057766663.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 4 287 1.3e-68 232.0 Protein kinase domain
XP_057766663.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 5 199 3.1e-36 125.7 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057766664.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 4 287 1.3e-68 232.0 Protein kinase domain
XP_057766664.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 5 199 3.1e-36 125.7 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057766665.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 4 283 1.6e-71 241.5 Protein kinase domain
XP_057766665.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 5 195 8.3e-35 121.1 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057766666.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 4 283 1.6e-71 241.5 Protein kinase domain
XP_057766666.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 5 195 8.3e-35 121.1 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057766667.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 4 283 1.6e-71 241.5 Protein kinase domain
XP_057766667.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 5 195 8.3e-35 121.1 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057766668.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 4 283 1.6e-71 241.5 Protein kinase domain
XP_057766668.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 5 195 8.3e-35 121.1 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057766669.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 4 283 1.6e-71 241.5 Protein kinase domain
XP_057766669.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 5 195 8.3e-35 121.1 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057766670.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 4 283 1.6e-71 241.5 Protein kinase domain
XP_057766670.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 5 195 8.3e-35 121.1 Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

10 records

下载 cDNA FASTA
XM_057910687.1
GTAAAACCAAACAAATTTTCTCCTCACAAATAAATTTTTTATATGAAAAAAGATGTTTTCTGACAAAAAAAAAATTGAATGCAAAGAAAGAAGCCCTAGTATATGTTGGGTTTCCTTGCAAATTGCAATTCAGAATGTGAAAATATTCTCCAAATAATGATGCAAGGAAAAGGAAAGTAAAATTTCGATTCCCTATCCCGCTGGTGGGGGGAAATTCCTTTTACCCAGTTTCTTGCGCATAAAGCCAAAGAATCTCGTCG...
XM_057910679.1
AAATATTCTCCAAATAATGATGCAAGGAAAAGGAAAGTAAAATTTCGATTCCCTATCCCGCTGGTGGGGGGAAATTCCTTTTACCCAGTTTCTTGCGCATAAAGCCAAAGAATCTCGTCGATTTTTTCTACCTTTTTACCTTTATTACCATTCATCTCACGTTTATTATGTGTATGTATGTAGTATGTCCTCATCATTGCCGTATCATCACAATCGCTGCATTAAATATACAGCGGCGGCTGGTACGCAATCCCAAAAAT...

CDS

10 records

下载 CDS FASTA
lcl|NC_080391.1_cds_XP_057766665.1_29387
ATGGAAAGATTCAAGGTCATAAAAGAAGTTGGTAATGGTGCTTTTGGAAGTGTTTGGAGAGCTCTAAGCAAGCAATCTGGTGAAGTGGTTGCGATAAAAAAAATGAAGAAGAAATATTATTCATGGGAAGAATGCATAAATCTGAGAGAAGTCAAGTCGCTGAAGAAAATGAACCATCCAAATATAGTAAAGCTGAAGGAAGTAATTAGGGAGAATGATGTGTTGTACTTTGTTTTTGAGTACATGGAATTCAATCTATA...
lcl|NC_080391.1_cds_XP_057766666.1_29388
ATGGAAAGATTCAAGGTCATAAAAGAAGTTGGTAATGGTGCTTTTGGAAGTGTTTGGAGAGCTCTAAGCAAGCAATCTGGTGAAGTGGTTGCGATAAAAAAAATGAAGAAGAAATATTATTCATGGGAAGAATGCATAAATCTGAGAGAAGTCAAGTCGCTGAAGAAAATGAACCATCCAAATATAGTAAAGCTGAAGGAAGTAATTAGGGAGAATGATGTGTTGTACTTTGTTTTTGAGTACATGGAATTCAATCTATA...

Protein

10 records

下载 Protein FASTA
XP_057766661.1
MERFKVIKEVGNGAFGSVWRALSKQSGEVLHCQVAIKKMKKKYYSWEECINLREVKSLKKMNHPNIVKLKEVIRENDVLYFVFEYMEFNLYQLMKDRVKLFSEVEVRNWCFQVFQGLACIHQGGFFHRDLKPENLLVSKDVIKVADFGLAREINSLPPFTDYVSTRWYRAPEVLLQSSVYGPPVDMWAMGAIMAELFTLRPLFPGTSEADEIYKICCVIGSPTYNEWAEGLRLASTINYQFPQVAGVDLSMLMPGVSGDA...
XP_057766662.1
MERFKVIKEVGNGAFGSVWRALSKQSGEVLHCQVAIKKMKKKYYSWEECINLREVKSLKKMNHPNIVKLKEVIRENDVLYFVFEYMEFNLYQLMKDRVKLFSEVEVRNWCFQVFQGLACIHQGGFFHRDLKPENLLVSKDVIKVADFGLAREINSLPPFTDYVSTRWYRAPEVLLQSSVYGPPVDMWAMGAIMAELFTLRPLFPGTSEADEIYKICCVIGSPTYNEWAEGLRLASTINYQFPQVAGVDLSMLMPGVSGDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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