当前解析结果
SmilChr05G003601| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003601 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003601 |
| 描述 | anamorsin homolog |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 48093861 - 48097203 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987094 |
|---|---|
| GeneID | 130987094 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987094 |
| 原始查询 | LOC130987094 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | anamorsin homolog |
| 产物 | anamorsin homolog |
| Arabidopsis | AT5G18400 (AT5G18400)Cytokine-induced anti-apoptosis inhibitor 1, Fe-S biosi [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831958] identity=55; qcov=1.06; evalue=1.03e-81; confidence=high |
| Rice | Os04g0674400- identity=53.2; qcov=1.03; evalue=2.62e-87; confidence=high |
| GO | GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0051536 (iron-sulfur cluster binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF05093 (CIAPIN1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987094 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057766687.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057766687.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766687.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766687.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057766687.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:48094271 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:48094285 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C26 |
Chr5:48095116 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C27 |
Chr5:48095823 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr5:48095839 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B107,D9 |
Chr5:48095839 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,D9 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057766687.1PF05093
CIAPIN1 210-246 aa
XP_057766688.1PF05093
CIAPIN1 211-248 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057766687.1 |
Pfam | PF05093 |
CIAPIN1 | Domain | 210 | 246 | 3.3e-16 | 60.3 | Cytokine-induced anti-apoptosis inhibitor 1, Fe-S biogenesis |
XP_057766688.1 |
Pfam | PF05093 |
CIAPIN1 | Domain | 211 | 248 | 3.8e-17 | 63.3 | Cytokine-induced anti-apoptosis inhibitor 1, Fe-S biogenesis |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。