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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003618`

染色体: Chr05 坐标: 48306003-48308535 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003618`
名称	SmilChr05G003618
描述	lysine-specific demethylase JMJ32
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	48306003 - 48308535 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987109`
GeneID	`130987109`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987109`
原始查询	`LOC130987109`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine-specific demethylase JMJ32
产物	lysine-specific demethylase JMJ32
Arabidopsis	`AT3G45880` (AT3G45880) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823731] identity=60.5; qcov=0.906; evalue=4.03e-149; confidence=high
Rice	`Os09g0483600` (JMJ714) - identity=55.5; qcov=0.906; evalue=6.28e-128; confidence=high
GO	GO:0016706 (2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13621 (Cupin_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987109

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766714.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766714.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057766714.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766714.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766714.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:48306202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,D10
`Chr5:48306229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C24,C3
`Chr5:48306241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:48306397`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C76
`Chr5:48306397`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C76
`Chr5:48306487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr5:48306576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B139,B140,D4
`Chr5:48306578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr5:48306640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr5:48306666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B42,B43,D6
`Chr5:48306756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,A8,B35,B7
`Chr5:48307444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766714.1

372 aa

186

372

Cupin_8

PF13621 Cupin_8 36-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766714.1`	Pfam	`PF13621`	Cupin_8	Domain	36	316	7e-70	236.5	Cupin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910731.1
GAACATTCCCCCATAATTTAAGGTAAAGTTAAAAGGGGCGCAATTGTAATTCGCCCTAAATACAGAGTTGGGATTTGGGAGATCACTTCTCAAATACTACTTGAAAATTTGAATTCATCCAACTGACAAACCATGAGCTTCAAAATCTTCGTGAATGGCAGAAAACATCGATTTCTCGATTCAAAATCTATGGCAAGACGTAAGAGAACTAAGCCTAGGCGCCCCGCCCAACATTGACCGCCTACCCTCCCCACCCACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987109
ATGGCAGAAAACATCGATTTCTCGATTCAAAATCTATGGCAAGACGTAAGAGAACTAAGCCTAGGCGCCCCGCCCAACATTGACCGCCTACCCTCCCCACCCACCCCCCTCGAGTTCCTCCGCCGCTACGTAGCCCCCAATAAACCATGCCTTATCTCCGCCGCCGTCCCTCACTGGCCCGCACTCTCCTTATGGCCCTCCACCAACTACCTCCGGACCACCCTCTCCACTACCCCCGTCTCTCTCCACCTCACCCCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766714.1
MAENIDFSIQNLWQDVRELSLGAPPNIDRLPSPPTPLEFLRRYVAPNKPCLISAAVPHWPALSLWPSTNYLRTTLSTTPVSLHLTPTGKADALAPHPSAPSTLCFASAHVETLPFPQALDSVFASDNEKNKVAYLQQQNDCFRREYGALAADCEDHVPWATAALGCAPEAVNFWVGNNSSETSFHKDHYENLYVVITGEKRFLLLPPTDFHRTYVREYPAAKYLYHQDSGEFSLELEDPATNVPWCSVDPYPSPQEKRRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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