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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002811`

染色体: Chr01 坐标: 46660798-46662101 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002811`
名称	SmilChr01G002811
描述	uncharacterized SmilChr01G002811
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46660798 - 46662101 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987124`
GeneID	`130987124`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987124`
原始查询	`LOC130987124`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G35695` (AT5G35695) nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543] identity=37.8; qcov=1.04; evalue=4.46e-38; confidence=medium
Rice	`Os03g0643050` - identity=43.3; qcov=1.04; evalue=1.52e-53; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987124

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766724.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057766724.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057766724.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057766724.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766724.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46661051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr1:46661054`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr1:46661054`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr1:46661066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C83
`Chr1:46661074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B129
`Chr1:46661109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B62
`Chr1:46661115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:46661116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:46661246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B108,B15,B28,C23
`Chr1:46661270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr1:46661329`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B15,B3,B52,B70,C13,C15,C68,C77
`Chr1:46661334`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766724.1

186 aa

186

DDE_Tnp_4

DDE_Tnp_1

Plant_tran

PF13359 DDE_Tnp_4 2-125 aa PF01609 DDE_Tnp_1 12-125 aa PF04827 Plant_tran 71-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766724.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	2	125	1.7e-17	64.2	DDE superfamily endonuclease
`XP_057766724.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	12	125	5.7e-07	30.2	Transposase DDE domain
`XP_057766724.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	71	128	2.6e-05	24.7	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910741.1
CACAATAAAATCATTTGAAATATCTCAGTTTGCTTGATCATATCCTACTATTGATTGGTTTTTCTAATAGTTTTATTTCCTTTTTCTTGTTTGCAATCTGTTGTGAATAGGGCTGTCTAGGTGCTTTAGATGGCACCTACATAAATGTCACAGTTAGCAATATGGATAAGCCAAGATATAGGACTCGGAAAGGCTAAATATCTACAAACACCCTAGCTGTTTGTGACCGGAACATGAAGTTTGCATATGTCCTCCCTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987124
ATGAAGTTTGCATATGTCCTCCCTGGATGGGAAGGCTCAGCAGCAGACTCTAGAATATTACGTGATGCTTTGAATCGAGACAATGGCCTTAAAGTGCCTAAGGGGAATTACTATTTGTGTGACAACGGTTATGCAAATAGTGAAGGGTTCCTAACCCCTTACAAAGGGGTTAGATATCATTTGAAAGAGTGGGGTCCGACAAATGCTAGACCACAAAATAAGGAAGAGATATTCAATTTGAAGCACAGTAAGGCACGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766724.1
MKFAYVLPGWEGSAADSRILRDALNRDNGLKVPKGNYYLCDNGYANSEGFLTPYKGVRYHLKEWGPTNARPQNKEEIFNLKHSKARNVIERAFGVMKMRWGVLRSTTFYPIKIQNRLIMACFLINNFIRSEMAVDPIEQQYDLLNGEVQAIADGEELVDTVESSPEWNAARDNIAQGMWNEYINAI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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