Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003651`

染色体: Chr05 坐标: 49124806-49126396 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003651`
名称	SmilChr05G003651
描述	nudix hydrolase 3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	49124806 - 49126396 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987137`
GeneID	`130987137`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987137`
原始查询	`LOC130987137`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nudix hydrolase 3-like
产物	nudix hydrolase 3-like
Arabidopsis	`AT1G79690` (NUDT3) nudix hydrolase homolog 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844308] identity=79.75; qcov=0.798; evalue=6.39e-42; confidence=medium
Rice	`Os02g0793300` - identity=77.22; qcov=0.798; evalue=2.65e-38; confidence=medium
GO	GO:0004452 (isopentenyl-diphosphate delta-isomerase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009240 (isopentenyl diphosphate biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987137

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057766746.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057766746.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:49126196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910763.1
TTAAGAATCCTAATCCAATTTCGCTTCTTCCAATTCAAAAATTCCCACAGAAAATGAATAAAATATTCCCATAAACAATTGTTTCTCCAGATAAAGGCCCTTTCCTGCCGGGAGAAATGAATGCAGTAATTTAATCCCAAGTTGAGCCATTTTGTCAATTCTTCCCATAATTCAAAAAGAAAAATTGTTGATTCTACCACTAATCCACCATCGCTTCTTAACCCAATTTTCCTCTCCTCTTTCTGACATATTATCAAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987137
ATGTCTACTCATTTGAGTGAGCAGGTTGTCCAAGTAGAGTATCTTGATGTCCTCACCAAGACTGGAGAGAAAACTGGCGTTTCAAAACCCAGGGGTGATGTCCACAGAGATGGTGACTATCATCGAGCTGTACATGTGTGGATATTTGCTGAGAGTACGCAAGAACTCCTTATTCAACTTCGTGCTGAATGCAAAGATTCCTGGCCTGGCCATTGGGACATCTCTAGTGCAGGTCATATCTCCGCAGGAGATTCATCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766746.1
MSTHLSEQVVQVEYLDVLTKTGEKTGVSKPRGDVHRDGDYHRAVHVWIFAESTQELLIQLRAECKDSWPGHWDISSAGHISAGDSSLVTARYSSFYCVD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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