Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003672`

染色体: Chr05 坐标: 49710826-49713094 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003672`
名称	SmilChr05G003672
描述	uncharacterized SmilChr05G003672
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	49710826 - 49713094 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987152`
GeneID	`130987152`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987152`
原始查询	`LOC130987152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987152

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766776.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057766776.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057766776.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057766776.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766776.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:49711666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr5:49711675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr5:49711701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B59,C40
`Chr5:49711714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B105,B33,C29
`Chr5:49711719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:49711727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C16,C87
`Chr5:49711771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:49711780`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr5:49711780`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C62
`Chr5:49711783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr5:49711796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr5:49711798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910794.1
TCATGTCTACCTCACGAGGTTTCTTGGGATTTCGGGGGCGATCTGGCGTTAATGCGCCAGAAGCTACTGCAGATACATCTGATGGGTCCGGGACGCACATTTCTGGGACTCCCGAGACTCTCCAGGCTTCTAGTAGTTCACGGGCTAGAAGGCCTAGGGGCCCTACAGCTGCTGATATCAGAGAGAGAGTTCGTAAGGCTGCAGATGGGAGGACGGTATTTGAGAGGCATCCTACGACTGGGTAAGCATTTGAGTTTAAT...

XM_057910793.1
TCATGTCTACCTCACGAGGTTTCTTGGGATTTCGGGGGCGATCTGGCGTTAATGCGCCAGAAGCTACTGCAGATACATCTGATGGGTCCGGGACGCACATTTCTGGGACTCCCGAGACTCTCCAGGCTTCTAGTAGTTCACGGGCTAGAAGGCCTAGGGGCCCTACAGCTGCTGATATCAGAGAGAGAGTTCGTAAGGCTGCAGATGGGAGGACGGTATTTGAGAGGCATCCTACGACTGGGTAAGCATTTGAGTTTAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987152
ATGCATCTACAGAGCTTGGATCCTGGTACTCCCCAGGATGCACCGAACTATGCCACCTTCCTCCGCCTCCACACGTGCGCCGACGGAAGTTATACGTCGGAGAGAGATGCTAGAATTGACGCCGAGGTTCATCGACTGGCCGCTGCCACAGGACGACAGGAGCGGCTAGACGAGGTGTATTTGGAGGTGGTGCAAATTGATAGGTCACGGATCTACGGCGTCGGGAGTGCCGGGCAGAGTCAGGCTAGTAGGGGGTCTAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766776.1
MHLQSLDPGTPQDAPNYATFLRLHTCADGSYTSERDARIDAEVHRLAAATGRQERLDEVYLEVVQIDRSRIYGVGSAGQSQASRGSIRSTGSSAVSQQLYETRISTLEEQLAAEQAQRQQMEDRMAQLEAFMRMYNAQPPPGPDADDDDDDA

XP_057766777.1
MHLQSLDPGTPQDAPNYATFLRLHTCADGSYTSERDARIDAEVHRLAAATGRQERLDEVYLEVVQIDRSRIYGVGSAGQSQASRGSIRSTGSSAVSQQLYETRISTLEEQLAAEQAQRQQMEDRMAQLEAFMRMYNAQPPPGPDADDDDDDA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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