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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003748`

染色体: Chr05 坐标: 50613956-50617805 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003748`
名称	SmilChr05G003748
描述	probable cyclic nucleotide-gated ion channel 14
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50613956 - 50617805 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987167`
GeneID	`130987167`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987167`
原始查询	`LOC130987167`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable cyclic nucleotide-gated ion channel 14
产物	probable cyclic nucleotide-gated ion channel 14
Arabidopsis	`AT2G24610` (CNGC14) cyclic nucleotide-gated channel 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816997] identity=66.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0789100` (OsCNGC5) - identity=58.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005216 (monoatomic ion channel activity); GO:0006811 (monoatomic ion transport); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00027 (cNMP_binding); PF00520 (Ion_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987167

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766794.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766794.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766794.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766794.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766794.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50614508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:50615733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:50616142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B35
`Chr5:50616143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr5:50616501`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B52
`Chr5:50616501`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B52
`Chr5:50616503`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B52
`Chr5:50616503`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B52
`Chr5:50616772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B70,B82,C78
`Chr5:50616797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C49
`Chr5:50616821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr5:50616826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766794.1

727 aa

364

727

Ion_trans

cNMP_binding

PF00520 Ion_trans 82-407 aa PF00027 cNMP_binding 503-592 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766794.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	82	407	1e-18	68.1	Ion transport protein
`XP_057766794.1`	Pfam	`PF00027`	cNMP_binding	Domain	503	592	8.1e-09	36.0	Cyclic nucleotide-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910811.1
ATGTAGCCCAAGTATTAGTGACGAGTCAACCATATACACTCATAGAACTTTCCACCTCATCCACAAAAAGACATTTTCGGATTTTTTGTGTCTCCATTTTTTCCCACACTGCTTCCTTTAATGTTTTCAATTAACTAAAGGGAGTTTGACAAATTATTGAATTCTGCAAAATTTTCAGCACAATAATCATAATCATGAATCAAGAAAAGAATTTTCTGGGTATAGCTTTTGTTTGCAGAGATTCAGTTCAAGATTGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987167
ATGGATTTCAAGAAAGAGAAACTTGTTAGGTTTCACAGTGAAGAAAAACGGAATCTTGAAGTTTTCTTGGAGAAAAATGAGGCTGAAAACCTAGACAAGGCACTCCCTTTGTTCAAGAATTCAACCCCTTTATGGAAATGTGAAGACAAGATTCCTAAGTTTGGCAGGGCTAAGGTTTATCCAGAAGGCTCAAAACCAGACAAGAAAGCAATTCTTGATCCTGGGAGTGAGATTGTGCTGAAATGGAACAGAGTTTTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766794.1
MDFKKEKLVRFHSEEKRNLEVFLEKNEAENLDKALPLFKNSTPLWKCEDKIPKFGRAKVYPEGSKPDKKAILDPGSEIVLKWNRVFLFSCIMALFVDPLFFYLPSVLNQDNSSCMHTDMNLGIIVTCFRTVADAFYLLHVIMKFRIAYVSPSSRVFGKGELVMDRNKIAMRYLKSEFFIDFIAALPLPQIVIWSILPAIRSSHADHTNNALVLIVLLQYIPRLYLIFPLSSEIIKANGLVTKTAWAGAAYNLVLYMLASH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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