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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003701`

染色体: Chr05 坐标: 50108968-50111515 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003701`
名称	SmilChr05G003701
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50108968 - 50111515 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987173`
GeneID	`130987173`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987173`
原始查询	`LOC130987173`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like
产物	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like
Arabidopsis	`AT5G45275` (AT5G45275) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2746193] identity=62; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0107400` (OsMFS6) - identity=53.4; qcov=0.944; evalue=1.14e-172; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06813 (Nodulin-like); PF23262 (NFD4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987173

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057766800.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057766800.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766800.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766800.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766800.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50109071`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	75	A1,A14,A19,A21,A22,A6,B10,B113,B117,B12,B121,B125,B13,B132,B134,B136,B28,B4,B41,B42,B43,B46,B5,B53,B56,B57,B58,B59,B63,B67,B72,B74,B75,B8,B80,B86,B88,B9,B90,B91,B92,B96,C12,C14,C16,C19,C2,C21,C24,C29,C3,C31,C32,C35,C38,C4,C41,C42,C47,C50,C54,C55,C58,C59,C68,C7,C73,C75,C76,C79,C82,C83,C9,D11,D7
`Chr5:50109072`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	43	A18,A8,A9,B109,B112,B119,B120,B129,B130,B131,B133,B14,B140,B18,B26,B35,B37,B47,B49,B55,B6,B77,B85,B87,B93,B99,C1,C18,C28,C37,C43,C44,C56,C63,C65,C72,C74,C85,D1,D10,D2,D4,D6
`Chr5:50109199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr5:50109313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B56,B96,C38
`Chr5:50109437`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B53
`Chr5:50109437`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B53
`Chr5:50109439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr5:50110116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B88
`Chr5:50110257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B58,B76,B94,D7
`Chr5:50110370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B69,B9,C5,C58
`Chr5:50110569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr5:50110599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766800.1

585 aa

292

585

Nodulin-like

NFD4_C

PF06813 Nodulin-like 33-276 aa PF23262 NFD4_C 354-565 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766800.1`	Pfam	`PF06813`	Nodulin-like	Domain	33	276	5.3e-80	269.3	Nodulin-like
`XP_057766800.1`	Pfam	`PF23262`	NFD4_C	Domain	354	565	3e-44	152.1	NFD4, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910817.1
CTAAAATTGTGAGACAAAGCTTTGGTTTTGTCATTTAATTACATCCCAAAAAATTAGTTAGCGTCTTTCAACTGCCTTAAACGCAATGACATCACCAAACACTTATTTTTCTCACCAAACTCAAAGCTTTTACTGCACTCGCTTGCTCATCGTCCCAGCAACAATGGTGGGGCAATCGAGGAAATGGATGGTGCTGGTGGCGACGATTTGGATTCAGGCCTTCACGGGGACGAACCTGGACTTCTCGGCCTACTCGTCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987173
ATGACATCACCAAACACTTATTTTTCTCACCAAACTCAAAGCTTTTACTGCACTCGCTTGCTCATCGTCCCAGCAACAATGGTGGGGCAATCGAGGAAATGGATGGTGCTGGTGGCGACGATTTGGATTCAGGCCTTCACGGGGACGAACCTGGACTTCTCGGCCTACTCGTCGGAGCTGAAGTCGGTTTTGGGGGTGTCGCAGGTGCAGCTCAACTATCTCGCCACCGCGTCCGACCTCGGCAAGGCCGTGGGCTGGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766800.1
MTSPNTYFSHQTQSFYCTRLLIVPATMVGQSRKWMVLVATIWIQAFTGTNLDFSAYSSELKSVLGVSQVQLNYLATASDLGKAVGWSSGLALMWLPLWAVMFAAAAMGLIGYGAQWLVLTNAITLPYSVVFILCLLAGCSICWFNTVCFVLCIKNFPSSMPLALSLTVSFNGVSAALYNLVVKSFNPSSSATYLLLNALIPLFTSVVALIPILRQPPLDSLDPDAGKRDKLTFLKLNMLAFVTGLYLLFLHPSDSSTARL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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