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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003696`

染色体: Chr05 坐标: 50066564-50071113 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003696`
名称	SmilChr05G003696
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50066564 - 50071113 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987176`
GeneID	`130987176`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987176`
原始查询	`LOC130987176`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like
产物	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like
Arabidopsis	`AT5G45275` (AT5G45275) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2746193] identity=67.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0107400` (OsMFS6) - identity=55.6; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06813 (Nodulin-like); PF23262 (NFD4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987176

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057766805.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057766805.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766805.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766805.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766805.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50066702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:50066728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C24,C3
`Chr5:50066866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:50066899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:50069623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B104,C1,C43,C76
`Chr5:50069704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:50069725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:50069870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,C1,C43,C76
`Chr5:50069981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr5:50070142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B68
`Chr5:50070196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C24,C3
`Chr5:50070204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B48,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766805.1

563 aa

282

563

Nodulin-like

NFD4_C

PF06813 Nodulin-like 7-250 aa PF23262 NFD4_C 346-548 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766805.1`	Pfam	`PF06813`	Nodulin-like	Domain	7	250	1.1e-76	258.4	Nodulin-like
`XP_057766805.1`	Pfam	`PF23262`	NFD4_C	Domain	346	548	5.1e-49	167.7	NFD4, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910822.1
ATAATAATAATACTAATAATAATAATAATTCGCAAGCGTATATAATAAAACCCTTTCTTCACCAAACGCAATTTCAACTGAATTCCGCGAATTTCTCCGGCGACCACCATGGCTGGGGAATCGAGGAAATGGATGATTCTGGTGGCAACGATTTGGATTCAGGCGTTCACGGGGACGAATTTCGACTTCTCGGCGTACTCGTCGGAGTTGAAGACGGTTTTGGGGGTGTCGCAGGTGCAGCTCAACTACCTCGCCACCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987176
ATGGCTGGGGAATCGAGGAAATGGATGATTCTGGTGGCAACGATTTGGATTCAGGCGTTCACGGGGACGAATTTCGACTTCTCGGCGTACTCGTCGGAGTTGAAGACGGTTTTGGGGGTGTCGCAGGTGCAGCTCAACTACCTCGCCACCGCGTCGGACCTCGGGAAGGCGGTGGGGTGGTCGTCGGGTGTGGCGCTGATGTGGATGCCGCTGTGGGCGGTGATGTTCGCGGCGGCGGCGATGGGGTTCGTCGGCTACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766805.1
MAGESRKWMILVATIWIQAFTGTNFDFSAYSSELKTVLGVSQVQLNYLATASDLGKAVGWSSGVALMWMPLWAVMFAAAAMGFVGYGTQWLVISNVITLPYFVVFLLCLLAGCSICWFNTVCFVLCIKNFPSSIPLALSLTVSFNGVSAALYNLAVKSLNPSSSAVYLLLNALIPLFTSLVALIPILRQPSLDLLDPNVVKRDHFTFLKLNVLAFITGLYLLFLHPSDSFTARLLWYGAIFLLILPLGIPGILYAREWFH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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