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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002818`

染色体: Chr01 坐标: 46751277-46755300 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002818`
名称	SmilChr01G002818
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46751277 - 46755300 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987190`
GeneID	`130987190`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987190`
原始查询	`LOC130987190`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 1
产物	vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 1
Arabidopsis	`AT2G06530` (VPS2.1) SNF7 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815211] identity=92; qcov=1; evalue=3.22e-135; confidence=high
Rice	`Os07g0236800` (P0407H12.144) - identity=84.4; qcov=1; evalue=2.79e-121; confidence=high
GO	GO:0000815 (ESCRT III complex); GO:0005771 (multivesicular body); GO:0015031 (protein transport); GO:0032509 (endosome transport via multivesicular body sorting pathway); GO:0045324 (late endosome to vacuole transport)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03357 (Snf7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987190

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766824.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766824.1`
3	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057766824.1`
4	Endosome	内体	0.80000	`XP_057766824.1`
5	Midbody	Midbody	0.80000	`XP_057766824.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46754803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,C16,C32,C68
`Chr1:46755041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C61
`Chr1:46755057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B9,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766824.1

224 aa

112

224

Snf7

PF03357 Snf7 17-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766824.1`	Pfam	`PF03357`	Snf7	Family	17	186	1.7e-48	165.2	Snf7

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910841.1
TTTTATTGCTGGCCATTTACCTAAACCTACAAGCCCAAATATTGAGCCCATTTATGATATGGCTCAAGATATTATATTGGCCCAATGATATATGAGAACAATATCTAACAACTCCGTTTTGAACAGATAAAGCGCATAAGTGATCGATTCTTCGCCGCGTTGATTTCTACGTGTATAATATTCTTATTCGGCTCCGCGTCGTTTGATTAAAACCCCCTTCTTTCTGCAATTTCCTTTGTATAATTTTGTGTTTTTCAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987190
ATGAGTTTCCTTTTCGGGAAGAGGAAGACTCCCGCAGAGCTTCTGCGGGAAAACAAGAGAATGCTTGATAAGTCAATTCGAGAAATAGAGAGGGAAAGACAAGGTTTACAAACGCAAGAAAAGAAACTTATCGCGGAGATAAAGAAAAGCGCTAAACAAGGACAGATGGGAGCTGTCAAGGTGATGGCCAAAGATCTTATCAGGACAAGACATCAGATTGAAAAGTTCTATAAGCTGAAATCTCAACTTCAAGGTGTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766824.1
MSFLFGKRKTPAELLRENKRMLDKSIREIERERQGLQTQEKKLIAEIKKSAKQGQMGAVKVMAKDLIRTRHQIEKFYKLKSQLQGVSLRIQTLKSTQAMGEAMKGVTKAMGQMNRQMNLPSLQKIMQEFERQNEKMELTSEVMADAIDDALEGDEEEEETEELVSQVLDEIGIDINNELVNAPSAAVAAPAAKNKVPQAEATTGTDDGGIDSDLQARLDNLRRM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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