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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003746`

染色体: Chr05 坐标: 50579835-50581289 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003746`
名称	SmilChr05G003746
描述	probable WRKY transcription factor 17
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50579835 - 50581289 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987198`
GeneID	`130987198`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987198`
原始查询	`LOC130987198`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 17
产物	probable WRKY transcription factor 17
Arabidopsis	`AT4G31550` (WRKY11) WRKY DNA-binding protein 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829282] identity=47.2; qcov=1.08; evalue=2.69e-80; confidence=high
Rice	`Os04g0605100` (OsWRKY68) - identity=47.1; qcov=1.01; evalue=2.81e-62; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY); PF10533 (Plant_zn_clust)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987198

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766830.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766830.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766830.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766830.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766830.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50580325`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	B121,B136,B15,B16,B79,B8,B86,B94,C13,C15,C18,C21
`Chr5:50580331`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B121,B131,B136,B15,B16,B79,B8,B86,B94,C13,C15,C18,C21
`Chr5:50580529`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B45
`Chr5:50580529`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B45
`Chr5:50580569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr5:50580589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:50580690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr5:50580693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A3,B140
`Chr5:50580739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B35
`Chr5:50580755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:50580889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:50580901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B70,B82,C71,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766830.1

295 aa

148

295

Plant_zn_clust

WRKY

PF10533 Plant_zn_clust 175-217 aa PF03106 WRKY 221-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766830.1`	Pfam	`PF10533`	Plant_zn_clust	Domain	175	217	3.4e-15	56.6	Plant zinc cluster domain
`XP_057766830.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	221	277	7.1e-27	94.1	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910847.1
AAATAAAGTGGATCCAATTTATTCAACACTCAATGGCGTTGACCCCTTTAAATGGTTAAGAATTCAAAGTTTGACTCAACCTACTGACCCGGTCACCCATCCACATCCTTTCACCATATATACATTCCCCTTCCCACACTCCCATCTCTTATCTCCAATTCAAAGAAATTTCCTTGTAGCGACAAGCCTCAGATTTCTGCAGATTACAGCTTCCGATTTCCGCCGCAGAAATGGCCGTCGATTTGCTCGGCTACCGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987198
ATGGCCGTCGATTTGCTCGGCTACCGGAATCTCAACCGCCATGCGCCGCCGGTCCAAGAAGCCGCTCCAGCTGGTTTCAAATCGATGCAACAATTAATCCTTGCTGCTTCTCACCAAAATCAGCCGTCGAATTTCACGGTTTTCAGCTCGCAAAAGGTCAGTTCAAACGTGAATCGAACCGGTCACGCCCGCTTCCGGCGCGCTCTGGTTCAGCCTGAACCAGCTTTGCCTCCGGTTCAGTATTCTGAACCCCGGGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766830.1
MAVDLLGYRNLNRHAPPVQEAAPAGFKSMQQLILAASHQNQPSNFTVFSSQKVSSNVNRTGHARFRRALVQPEPALPPVQYSEPRDSGSHQLQTLNLFSDSPASAAAAAPARALDLSKEMIGDDVLSLSATVSTSGNSSATFASTITGEGSVSNGKSGALSTVPISAGKPPLSGKRCREHDNISGKISDSSRCHCKKRKYRVKRTIRVPAVSSKVSDIPADEYSWRKYGQKPIKGSPHPRGYYKCSTVKGCPARKHVERA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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