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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003741`

染色体: Chr05 坐标: 50498959-50502952 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003741`
名称	SmilChr05G003741
描述	probable E3 ubiquitin-protein ligase HIP1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50498959 - 50502952 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987200`
GeneID	`130987200`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987200`
原始查询	`LOC130987200`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable E3 ubiquitin-protein ligase HIP1
产物	probable E3 ubiquitin-protein ligase HIP1
Arabidopsis	`AT5G24870` (AT5G24870) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832556] identity=56.5; qcov=0.646; evalue=1.62e-54; confidence=high
Rice	`Os06g0695600` (OsMAR1) - identity=57.1; qcov=0.516; evalue=1.35e-47; confidence=medium
GO	GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987200

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766832.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057766832.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057766832.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057766832.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766832.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50499260`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C75
`Chr5:50499260`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C75
`Chr5:50499298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:50499300`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	157	A11,A14,A18,A2,A24,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B112,B115,B117,B12,B120,B121,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B16,B18,B19,B22,B24,B25,B27,B28,B3,B33,B34,B35,B36,B42,B43,B44,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B55,B56,B57,B58,B6,B61,B63,B64,B65,B66,B7,B71,B74,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B85,B86,B90,B91,B92,B93,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C22,C23,C24,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C36,C37,C4,C40,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C55,C56,C57,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C69,C7,C71,C72,C74,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C83,C84,C85,C86,D1,D10,D2,D4,D6,D9
`Chr5:50499301`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A25,D11
`Chr5:50499301`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A25,D11
`Chr5:50499427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr5:50499521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,C12,C3,C8
`Chr5:50499547`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	135	A14,A18,A2,A24,A25,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B101,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B112,B115,B120,B121,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B137,B16,B18,B19,B22,B24,B27,B28,B3,B31,B33,B34,B35,B36,B42,B43,B47,B48,B50,B51,B52,B55,B56,B57,B58,B61,B64,B65,B66,B7,B71,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B85,B90,B91,B92,B93,B96,B97,B98,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C17,C19,C2,C22,C23,C24,C27,C28,C3,C30,C31,C33,C36,C37,C4,C40,C42,C43,C45,C47,C48,C49,C50,C51,C52,C55,C56,C57,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C69,C7,C71,C72,C74,C76,C78,C79,C80,C81,C83,C84,C85,C86,D1,D10,D11,D6,D9
`Chr5:50499570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B8
`Chr5:50499780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C48
`Chr5:50499834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910849.1
TGGTTTGATGGTTAAAACTAAAAGTGAAAAAATTCATGTTTATCATATCTCCCTTAAAACTGTCTGCCATCATCCTCGGATCTTTAACTCAATGTATTTATGATTATATTGTTATTATCCGCAAATATGATTTCATACTAAATTTAAACCCATCCCTTCTCTCTCTCACACTTAAAAAAGGGCAAAAGCCTTCTCGTATTAAGTGGTTGTTGGAAGCCTCTCCTTTTTTTTCTTGGTTTTTTCTTTCGTTGTAAAACAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987200
ATGAAGAAGAGAAGCCTAGAAGGGGATAGCAGCGAGTCCAGTAGAGGGAGACAAACAAGTGCAGCCGCACATGTCTCGTCTTCAAGTAGCAGCACCTCCGTCTCTGACTCTAGACACAGCAGTTGCCCCTCTGGTTCGGATAGCAGCACGTCTGCTTCTGTCAGGACAGGCGGGTCAGCTAATGTTAACAAGAGTAGGACGAGGCTTTCTTACCGACAAAACGGAAGAAATACTTCAAGCTTTAGAGAATCCTCGATCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766832.1
MKKRSLEGDSSESSRGRQTSAAAHVSSSSSSTSVSDSRHSSCPSGSDSSTSASVRTGGSANVNKSRTRLSYRQNGRNTSSFRESSIRVSRFPDSEPPRNVGRPRLSQQYSPNASSSGLSSYSLSHSSSNDDSRSTLMPYTSAEPGYSHFVNRDMLQRYNMDGIAEVLLALERIGQDEEMTHEQILALETSLFLNGLNLYDQHRDMRLDIDDMSYEELLALGDRMGTVSTALSEKELSKCIKRSIYQFTPTEAGFTESGED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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