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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000762`

染色体: Chr01 坐标: 16676500-16677957 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000762`
名称	SmilChr01G000762
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	16676500 - 16677957 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987202`
GeneID	`130987202`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987202`
原始查询	`LOC130987202`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=37.1; qcov=0.818; evalue=7.46e-52; confidence=medium
Rice	`Os06g0166100` - identity=35.2; qcov=0.838; evalue=4.49e-57; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987202

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766866.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766866.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766866.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766866.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766866.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:16676510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B53,B72,B92,C42
`Chr1:16676543`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	33	A19,A4,B1,B107,B114,B117,B136,B23,B28,B3,B60,B98,C11,C18,C23,C26,C29,C3,C35,C4,C41,C48,C5,C56,C57,C66,C68,C73,C75,C84,D10,D6,D9
`Chr1:16676544`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B4
`Chr1:16676544`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B4
`Chr1:16676545`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B27
`Chr1:16676545`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B27
`Chr1:16676554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C23
`Chr1:16676560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:16676566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:16676598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B12,D1
`Chr1:16676605`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B126
`Chr1:16676605`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B126

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766866.1

352 aa

176

352

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 71-160 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 249-336 aa PF10551 MULE 282-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766866.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	71	160	4.1e-19	69.8	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057766866.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	249	336	6e-10	39.8	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057766866.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	282	339	3.5e-13	50.5	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910883.1
ATGATGACTGATAATGCCGAGGAAACAAATGATGATACAAACACGGGGGGATCTAATTCACATACTCAAAATGATGATTCATCAAGTGTGAATGTGGAACAACGGAGTGAAAATACTTTACAAATCATGTCAAGTGCTCAAGGTGATCTTGATAATATTTGTGGATCTTTGGTTGGTGAAAAAGACGAGGATATTGAAAAACTCATGAAGTTGTACTCAGAACATGCTAAAAAGGTTGGATTTAGTGTGAGAAAATCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987202
ATGATGACTGATAATGCCGAGGAAACAAATGATGATACAAACACGGGGGGATCTAATTCACATACTCAAAATGATGATTCATCAAGTGTGAATGTGGAACAACGGAGTGAAAATACTTTACAAATCATGTCAAGTGCTCAAGGTGATCTTGATAATATTTGTGGATCTTTGGTTGGTGAAAAAGACGAGGATATTGAAAAACTCATGAAGTTGTACTCAGAACATGCTAAAAAGGTTGGATTTAGTGTGAGAAAATCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766866.1
MMTDNAEETNDDTNTGGSNSHTQNDDSSSVNVEQRSENTLQIMSSAQGDLDNICGSLVGEKDEDIEKLMKLYSEHAKKVGFSVRKSTTRYNSNGMLVSRVMVCSCQGLRKNASNVNEVRKKTVLTTRTDCKAFLRIKLSTSDEGLYEVKEHVLEHNHPLTREELSYMHRSNRTISDENAVIIEDMLSSGIGATDAYRYMAQEAGGEDMIGYTKRDCINYVNRLKILTIEGGDAQTLLNILEDQSAENDDFFYRVRLDEDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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