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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003689`

染色体: Chr05 坐标: 49999490-50697590 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003689`
名称	SmilChr05G003689
描述	uncharacterized SmilChr05G003689
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	49999490 - 50697590 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987205`
GeneID	`130987205`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987205`
原始查询	`LOC130987205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleolar essential protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824867]; symbol=AT3G57000; hit=AT3G57000; species=arabidopsis; confidence=high
产物	nucleolar essential protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824867]; symbol=AT3G57000; hit=AT3G57000; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G57000` (AT3G57000) nucleolar essential protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824867] identity=53.4; qcov=1.06; evalue=1.78e-105; confidence=high
Rice	`Os02g0290400` - identity=50.9; qcov=1.01; evalue=3.29e-93; confidence=high
GO	GO:0005730 (nucleolus); GO:0019843 (rRNA binding); GO:0032040 (small-subunit processome); GO:0070037 (rRNA (pseudouridine) methyltransferase activity); GO:0070475 (rRNA base methylation)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03587 (EMG1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987205

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766833.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057766833.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057766833.1`
4	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.20000	`XP_057766833.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766833.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50694960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr5:50696301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C2
`Chr5:50696382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B13
`Chr5:50696845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr5:50697063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B53,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766833.1

282 aa

141

282

EMG1

PF03587 EMG1 79-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766833.1`	Pfam	`PF03587`	EMG1	Family	79	276	7.6e-61	205.8	EMG1/NEP1 methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089596.1
TTTTTTCTTTTTCATTTTCTTACTCCTTTCCCAATCACACATTTCCCCGGCTTAACTATACACTAGCTTAGCTTAGGCCCAAATCAAGTCCATCAAAAGATCTGCCTATTAAACCTCTCTTCCTCATCGTCTCATCGCTTCTAAAACCCTAATTTTCTATCCCAATTCCAGCGAGCTACATGGGTTTAATTTCCCCAAATTTGTAGTCTACCGTCACATTAGGGACTATTACTTTATCTGTTTTGTGATTCTGCTATCGT...

XR_009089595.1
CACATTTCCCCGGCTTAACTATACACTAGCTTAGCTTAGGCCCAAATCAAGTCCATCAAAAGATCTGCCTATTAAACCTCTCTTCCTCATCGTCTCATCGCTTCTAAAACCCTAATTTTCTATCCCAATTCCAGCGAGCTACATGGGTTTAATTTCCCCAAATTTGTAGTCTACCGTCACATTAGGGACTATTACTTTATCTGTTTTGTGATTCTGCTATCGTTGTTTTGCATTCCTTTAGCCGAATCAGGGAAAATATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987205
ATGGGGCGGGCATACAAAATGAAAGGGCAGAAAAGGAAGAACAAAGGGGAGAAATACGACAGAGAGGAAGAACCGAAGCAATTAGTTGGAAATTTCACGCCGCAGCCGTCGAAGAAAGTGAAGACGGACGGCGCGGAGTCAGAAAAGGAGGAAAAATTGAAGACTGTGGTTGATGATATGCCCGGAATTCCGATTGCTCCACTTGATACGGGAAATAACAAGCAGGGCGTCATCTTTGTTCTCGAAAAGGCCTCGTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766833.1
MGRAYKMKGQKRKNKGEKYDREEEPKQLVGNFTPQPSKKVKTDGAESEKEEKLKTVVDDMPGIPIAPLDTGNNKQGVIFVLEKASLEIGKVGKTDQLLSSDEHANYLVKNKRNPADYRPDIAFQAIQTILDSRVNKSGRLKALYVRTQLGQLMEIKPHVRMPRTYKRFSGLMVQLLQKLNITATDNGEKLLRLVKNPVTQYLPTNSRKIGFSHSSEKLIDMYNYVGNINEELDLVFVLGAMAHGKIDEDYVEDYISISEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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