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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003695`

染色体: Chr05 坐标: 50061296-50063818 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003695`
名称	SmilChr05G003695
描述	uncharacterized SmilChr05G003695
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	50061296 - 50063818 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987213`
GeneID	`130987213`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987213`
原始查询	`LOC130987213`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0710000; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0710000; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G13340` (AT1G13340) Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837894] identity=43; qcov=0.979; evalue=3.64e-43; confidence=medium
Rice	`Os03g0710000` - identity=40.2; qcov=0.995; evalue=1.33e-45; confidence=medium
GO	GO:0015031 (protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF03398 (Ist1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987213

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766843.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057766843.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057766843.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766843.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766843.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:50061482`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B94
`Chr5:50061482`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B94
`Chr5:50061823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:50062008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C12,C3,C35,C8
`Chr5:50062178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B47,C56,C65,C85
`Chr5:50062221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766843.1

190 aa

190

Ist1

PF03398 Ist1 24-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766843.1`	Pfam	`PF03398`	Ist1	Family	24	186	3.4e-45	154.6	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910860.1
CATTAATCGCGGGAATTCAACTGCTAGCTAAATACAAGCTTTTCATCAAGTATCAAGATAATTAATCAAGAAAAGAACACACAACATGGGAAAGATACTGAATACTCTGCTAAGAAGGAGCCCATCAAAAACATCGTCGAAGCTGGCGATGATGGCCAGGCTCGCGATCTCGAGAATCGCGATCCTCAAGAACATCCACACCGCGAAGTGGAACATAGCGTGCTCCGATGCCCTCCAGCTATTGCCTGGAGGACATCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987213
ATGGGAAAGATACTGAATACTCTGCTAAGAAGGAGCCCATCAAAAACATCGTCGAAGCTGGCGATGATGGCCAGGCTCGCGATCTCGAGAATCGCGATCCTCAAGAACATCCACACCGCGAAGTGGAACATAGCGTGCTCCGATGCCCTCCAGCTATTGCCTGGAGGACATCCGAGACGAGAACTAGCCCTCATCAAGGCCGAGTTAGCCATCACGGAGCAAAAAACATTGGACGCGTATGCTATGATCGAGGTTTACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766843.1
MGKILNTLLRRSPSKTSSKLAMMARLAISRIAILKNIHTAKWNIACSDALQLLPGGHPRRELALIKAELAITEQKTLDAYAMIEVYCRLLAEKTEMITDSKECPNELKEMVSSLIFAASRCGQFPELEKIRQMLTSKYGKDFAYSAIEIRNNCGVHPKMVHKLSSLPPTMEAKENLLKKIARDNNIAYIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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