当前解析结果
SmilChr05G003757| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003757 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003757 |
| 描述 | ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 50739821 - 50745132 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130987230 |
|---|---|
| GeneID | 130987230 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987230 |
| 原始查询 | LOC130987230 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5 |
| 产物 | ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5 |
| Arabidopsis | AT1G05350 (AT1G05350)NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837034] identity=74.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os02g0506500- identity=74.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0071566 (UFM1 activating enzyme activity); GO:0071569 (protein ufmylation) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00899 (ThiF) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987230 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057766870.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057766870.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057766870.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766870.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766870.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:50740063 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B101,B122,B68,C35 |
Chr5:50740088 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B27,B38,B39,C2 |
Chr5:50740173 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr5:50741999 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A15,C12,C3,C8 |
Chr5:50743308 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C8 |
Chr5:50743342 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C65 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057766870.1PF00899
ThiF 65-319 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057766870.1 |
Pfam | PF00899 |
ThiF | Domain | 65 | 319 | 5.6e-56 | 190.1 | ThiF family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。