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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002824`

染色体: Chr01 坐标: 46793642-46795942 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002824`
名称	SmilChr01G002824
描述	protein ELF4-LIKE 4
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46793642 - 46795942 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987267`
GeneID	`130987267`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987267`
原始查询	`LOC130987267`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ELF4-LIKE 4
产物	protein ELF4-LIKE 4
Arabidopsis	`AT1G17455` (ELF4-L4) ELF4-like 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838318] identity=73.3; qcov=0.991; evalue=6.34e-53; confidence=high
Rice	`Os11g0621500` (ELF4_chr.11) - identity=72.9; qcov=1.01; evalue=2.46e-57; confidence=high
GO	GO:0009649 (entrainment of circadian clock); GO:0042753 (positive regulation of circadian rhythm)
KEGG	-
Pfam	PF07011 (Elf4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987267

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766873.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057766873.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057766873.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766873.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766873.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46794047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr1:46794271`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	133	A1,A13,A15,A16,A18,A2,A21,A23,A24,A4,A5,A7,A9,B1,B100,B101,B102,B104,B107,B110,B112,B12,B122,B123,B125,B126,B129,B130,B133,B134,B135,B136,B137,B14,B17,B2,B21,B23,B24,B26,B27,B29,B3,B30,B33,B34,B35,B44,B45,B46,B49,B50,B52,B53,B55,B56,B57,B6,B66,B67,B7,B70,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B82,B84,B85,B87,B88,B89,B90,B92,B93,B95,B96,C11,C12,C14,C16,C17,C18,C21,C24,C25,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C38,C39,C43,C47,C48,C5,C50,C52,C54,C56,C57,C59,C6,C61,C63,C67,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C75,C76,C78,C81,C83,C84,C85,C86,C87,D10,D11,D2,D3,D4,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766873.1

117 aa

117

Elf4

PF07011 Elf4 16-96 aa

XP_057766874.1

117 aa

117

Elf4

PF07011 Elf4 16-96 aa

XP_057766875.1

117 aa

117

Elf4

PF07011 Elf4 16-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766873.1`	Pfam	`PF07011`	Elf4	Domain	16	96	4.4e-41	139.4	Early Flowering 4 domain
`XP_057766874.1`	Pfam	`PF07011`	Elf4	Domain	16	96	4.4e-41	139.4	Early Flowering 4 domain
`XP_057766875.1`	Pfam	`PF07011`	Elf4	Domain	16	96	4.4e-41	139.4	Early Flowering 4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910890.1
AGCAAGAGTTGAGGAAAGTGAATTTGAGATGAAAGAAAAATAGTACTGCTTTACATAGTATTGTATACTATTTAGACAGAGTGAGGGTGGGTCGGAGCCTGACTGTCATATCTACATATTCTCCCTCTTTCTCTCTCTCGCTCCCCTCCGAGATTCGATTCATTCATCGCCGCCGATCTTTCCAACTCCTCTTCTTCTCTCCTCCTCCGTTTATAATGTTCCCAGTTTTCCAAGGTGTGCCTCTCTCGGGTTGAATATTA...

XM_057910891.1
TATATATAGCTGCACATATATAATAAGTATATTTCATCTTCACAAAATTCTCTCCTTCTTCTTCTTCTTTCTCTAGATAATGTTTCTTTCTTCTTTTTAAATTTCTTCCTCCAGCTTCCTAGGTTTCCGCGATTCTTGATTCTTGAAAATTCGCTACCAGAAAAAATATATATATTTTTATCCTCCATTATATTTCTGGTTGTCTAGTTTTCTGAAGTGGAGTGATGGAATTCTGTGAGACACTTGAGTTTCTTCTTTTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130987267
ATGGAGGGTGACACATTTTCTGGGCTTGGCAATGGCAGCAGCCAGCTTGATGGCAAGGTTATGCAGAGTTTTCAGAAAAGTTTTGTGCAAGTTCAGAATATATTGGATCAGAATAGGCTGCTGATCAATGAGATTAATCAAAACCACGAGTCGAAAATCCCAGATAATTTGAGCAGAAATGTTGGCCTAATTAGGGAGCTCAACAACAATATCAGGAGGGTTGTTGATCTCTATTCTGATCTCTCCACCTCCTTCACCAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057766873.1
MEGDTFSGLGNGSSQLDGKVMQSFQKSFVQVQNILDQNRLLINEINQNHESKIPDNLSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYSDLSTSFTKSMDASSEGDSSGVAFKSDGKAGHKRHRPGS

XP_057766874.1
MEGDTFSGLGNGSSQLDGKVMQSFQKSFVQVQNILDQNRLLINEINQNHESKIPDNLSRNVGLIRELNNNIRRVVDLYSDLSTSFTKSMDASSEGDSSGVAFKSDGKAGHKRHRPGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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