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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002826`

染色体: Chr01 坐标: 46865308-46866386 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002826`
名称	SmilChr01G002826
描述	stress-response A/B barrel domain-containing protein UP3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46865308 - 46866386 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987340`
GeneID	`130987340`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987340`
原始查询	`LOC130987340`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stress-response A/B barrel domain-containing protein UP3-like
产物	stress-response A/B barrel domain-containing protein UP3-like
Arabidopsis	`AT2G31670` (AT2G31670) Stress responsive alpha-beta barrel domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817723] identity=51.5; qcov=0.881; evalue=1.1e-80; confidence=high
Rice	`Os07g0609000` - identity=35.7; qcov=0.992; evalue=1.05e-21; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07876 (Dabb)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987340

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057766879.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057766879.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766879.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766879.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766879.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46865509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:46865553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:46865567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B3,B49,C18
`Chr1:46865706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B131
`Chr1:46865707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B113,B32,C57
`Chr1:46865713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr1:46865931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C36
`Chr1:46866033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,D7
`Chr1:46866102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr1:46866216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766879.1

260 aa

130

260

Dabb

PF07876 Dabb 43-138 aa PF07876 Dabb 155-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766879.1`	Pfam	`PF07876`	Dabb	Domain	43	138	1.2e-34	119.6	Stress responsive A/B Barrel Domain
`XP_057766879.1`	Pfam	`PF07876`	Dabb	Domain	155	249	1.2e-34	119.6	Stress responsive A/B Barrel Domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910896.1
AAAATAAAAAATGAATCACTTTCTTTAATAATATAGATTCAACTATAATTATTAGAACTAGTATCACTTTATAAGAGTATTTTTAGAGTGAAAATAAAATTAGCGTTGTTCCTATAAGAAAAGGTCGGCCGGCACTCCATCCCACTCCAACAATGCTTTGTGTGAGAGCCGCAGCCCGCACCAACGCCTTTGCCCTCCACTCCCCGCCGCCGCCACTCCGCCGCAACCTCCGCTCCCCTTTCTCCGTCAGAATGTCTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987340
ATGCTTTGTGTGAGAGCCGCAGCCCGCACCAACGCCTTTGCCCTCCACTCCCCGCCGCCGCCACTCCGCCGCAACCTCCGCTCCCCTTTCTCCGTCAGAATGTCTTCCTCCGCCCCCAACCAAATCATCGAACACGTCGTGCTACTGAAAGCGAAGCCCTCCGCCGACCCCTCCGCCGTCAACGACATGGTCCGCAACCTCAACGGCCTCGCAACCCTCGATTCTGTCCTCCACATCTCCGCCGGCCCCGTCACTCGCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766879.1
MLCVRAAARTNAFALHSPPPPLRRNLRSPFSVRMSSSAPNQIIEHVVLLKAKPSADPSAVNDMVRNLNGLATLDSVLHISAGPVTRCRSASLTFTHLLHARYRSKSDLASYTVDPTHVNVVVNYVKPVVDDVIAVDWVAEDFSGPVVVPPGAALRLTVMKLKEEAGESGKSEVLGIVRGIQEKFDSIKQLTAGENFSPERSNGFSIASVAVVKGAEELEALAAESELVNEQKNKAREFLDGVIVLDFTVPAPVPAAAPSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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