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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001741`

染色体: Chr06 坐标: 20086357-20088925 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001741`
名称	SmilChr06G001741
描述	uncharacterized SmilChr06G001741
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20086357 - 20088925 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987391`
GeneID	`130987391`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987391`
原始查询	`LOC130987391`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G35695` (AT5G35695) nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543] identity=34; qcov=0.952; evalue=6.99e-25; confidence=low
Rice	`Os03g0643050` - identity=37.6; qcov=0.988; evalue=1.64e-31; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987391

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766887.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057766887.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057766887.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057766887.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766887.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20086683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B101,C27,C82
`Chr6:20086683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C27,C82
`Chr6:20086685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C17
`Chr6:20086730`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B80
`Chr6:20086730`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B80
`Chr6:20086737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A10,C55
`Chr6:20086737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C55
`Chr6:20086795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	94	A13,A18,A25,A7,B1,B10,B102,B106,B107,B108,B112,B119,B124,B125,B13,B131,B135,B15,B19,B2,B22,B25,B26,B27,B30,B31,B32,B33,B34,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B43,B44,B47,B48,B49,B54,B62,B63,B7,B70,B74,B76,B78,B81,B84,B85,B90,B91,B92,B94,B95,B97,B98,C12,C14,C15,C18,C21,C25,C28,C29,C3,C31,C36,C37,C39,C4,C42,C43,C45,C47,C51,C53,C55,C56,C57,C6,C61,C62,C71,C73,C74,C76,C79,C8,C86,C87,D7,D9
`Chr6:20086820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:20086852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B42,B43,B76
`Chr6:20086862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr6:20086868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766887.1

167 aa

167

DDE_Tnp_4

Plant_tran

DDE_Tnp_1

PF13359 DDE_Tnp_4 12-106 aa PF04827 Plant_tran 51-109 aa PF01609 DDE_Tnp_1 61-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766887.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	12	106	9.3e-11	42.3	DDE superfamily endonuclease
`XP_057766887.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	51	109	3.7e-06	27.4	Plant transposon protein
`XP_057766887.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	61	105	1.6e-05	25.5	Transposase DDE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089712.1
TTGCAGCAAATATGAGCAAATCTACTATTCCAGCTCCATAATTGATCTCACCAACCCCACCAGATTTTTAATCTCTTTGTCTACAGTACCTGATATTATAATTGAGGTTGTCGAATTTATCCCTGAACACATTCGCCACTTGTTTCAATTTTTGTAATCCCGCCTCCCAGTTCGTCCGCAGAAGTCGCAAGCACGCAAGCGCTTACTTTGAAATCTTCACCATTCTTGTCGAGTTATACAAGTAGATCTGGAAAATTATG...

XM_057910904.1
TGATGGGAGGTATATCGGGGTAGAGGAGCAGGTTGCAATGTTTCTGTCTGTCTTAGCACACCACAAAAAAATAGGGTTGTTAGGTTTGACTTCTGGAGGTCCGGCCAGTTAGTTTCAAAGTTTGTGCACCTCGTTCTTAAGGCAATATTGAAATTGCACACAATTTTACTCGTCAAACCTTCACATGTTCCAGCCGATTGTCCCGACAACAGGTGGTGTTGGTTCAAGGGTTGTTTGGGTGCCCTTGACGGCAATTACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987391
ATGGTGAGTAATGCCGATAAGCCGAGGTATCGCACCCGTAAAGGCAATTATTATCTATGCGACAATGGGTATGCGAACACCGAGGGATTTCTTGGCCCATACAAAGGGGTATGCTATCACTTGAAGGAATGGGGCCCGATGGCATCCAGACCTCAAAATGCAATGGAGTTGTTCAACTTGCACCATTCGAAGGCACGCATTGTTATTGAACGTGCGTTTGGTATCATGAAAATGCGCTGGGGTATTTTGAGGAGCAGTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766887.1
MVSNADKPRYRTRKGNYYLCDNGYANTEGFLGPYKGVCYHLKEWGPMASRPQNAMELFNLHHSKARIVIERAFGIMKMRWGILRSSTFYPVKTQIRLIMSCFILNNFIWSEMPDDPIERKLDSVTENDQTELEIDAAFIDDIESSPQWNAERDALAQTMWLNYMNNT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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