当前解析结果
SmilChr06G001748| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001748 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001748 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001748 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 20253547 - 20256434 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987396 |
|---|---|
| GeneID | 130987396 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987396 |
| 原始查询 | LOC130987396 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987396 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057766899.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057766899.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766899.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766899.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057766899.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:20253653 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,B51 |
Chr6:20253696 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B23,C43,C81 |
Chr6:20253698 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 88 | A1,A14,A2,A5,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B111,B117,B118,B121,B123,B126,B127,B13,B130,B134,B136,B137,B139,B15,B17,B26,B27,B28,B29,B3,B34,B35,B36,B38,B40,B52,B58,B59,B6,B63,B64,B69,B70,B75,B77,B8,B81,B84,B86,B91,B94,C1,C11,C12,C13,C15,C17,C21,C23,C24,C27,C33,C37,C41,C45,C49,C51,C53,C56,C60,C65,C67,C69,C70,C71,C73,C82,C83,C85,C86,C87,D1,D5 |
Chr6:20253719 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B15,B91,C78,C85 |
Chr6:20253725 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 57 | A1,A10,A11,A19,A25,A5,A6,B114,B115,B13,B131,B21,B25,B36,B45,B46,B48,B53,B58,B60,B61,B66,B68,B7,B72,B73,B74,B76,B8,B82,B83,B85,B87,B90,B93,B97,C10,C20,C25,C28,C3,C35,C38,C39,C42,C47,C50,C57,C62,C68,C75,C82,C84,C86,D3,D7,D9 |
Chr6:20253761 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 33 | A16,A18,A21,A23,A24,B114,B124,B131,B135,B26,B27,B3,B30,B33,B46,B51,B53,B55,B69,B80,B83,B9,C23,C36,C40,C43,C54,C59,C61,C64,C66,C74,C79 |
Chr6:20253777 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B73,C22 |
Chr6:20253789 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 16 | A11,A23,A5,B127,B132,B31,B78,B86,C17,C30,C5,C53,C6,C83,C84,D9 |
Chr6:20253806 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,A5,B12 |
Chr6:20253829 |
C |
CT |
1bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 209 | A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B104,B105,B107,B109,B11,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B12,B120,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B138,B14,B140,B15,B16,B18,B19,B2,B20,B21,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B31,B32,B35,B37,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B46,B47,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B65,B66,B68,B7,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C74,C75,C76,C78,C8,C80,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D11,D2,D4,D5,D6,D8,D9 |
Chr6:20253844 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B125,C87 |
Chr6:20253850 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 87 | A16,A18,A20,A24,A6,A7,A8,B10,B100,B105,B11,B111,B113,B114,B118,B12,B122,B127,B129,B133,B134,B136,B137,B16,B19,B2,B26,B29,B31,B32,B35,B37,B40,B41,B42,B47,B5,B54,B55,B56,B57,B65,B7,B71,B74,B78,B80,B82,B86,B94,B97,C1,C10,C13,C17,C2,C21,C23,C24,C28,C29,C35,C36,C39,C40,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C54,C6,C61,C64,C66,C7,C74,C75,C76,C85,C87,C9,D11,D4,D8,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。