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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001752`

染色体: Chr06 坐标: 20382491-20387362 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001752`
名称	SmilChr06G001752
描述	protein MIS12 homolog
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20382491 - 20387362 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987400`
GeneID	`130987400`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987400`
原始查询	`LOC130987400`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MIS12 homolog
产物	protein MIS12 homolog
Arabidopsis	`AT5G35520` (MIS12) minichromosome instability 12 (mis12)-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833516] identity=46.1; qcov=0.809; evalue=1.82e-51; confidence=high
Rice	`Os02g0620100` - identity=38.1; qcov=0.764; evalue=5.62e-29; confidence=medium
GO	GO:0000070 (mitotic sister chromatid segregation); GO:0000278 (mitotic cell cycle); GO:0000775 (chromosome, centromeric region); GO:0005634 (nucleus); GO:0034501 (protein localization to kinetochore); GO:0051382 (kinetochore assembly)
KEGG	-
Pfam	PF05859 (Mis12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987400

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766904.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057766904.1`
3	Centromere	着丝粒	1.00000	`XP_057766904.1`
4	Spindle	Spindle	0.40000	`XP_057766904.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766904.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20383148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:20383608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:20383645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr6:20385072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C17,C74
`Chr6:20385112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:20385152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:20386571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr6:20387054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B101,B82,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766904.1

245 aa

122

245

Mis12

PF05859 Mis12 9-210 aa

XP_057766905.1

220 aa

110

220

Mis12

PF05859 Mis12 9-169 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766904.1`	Pfam	`PF05859`	Mis12	Family	9	210	3.2e-35	122.7	Mis12 protein
`XP_057766905.1`	Pfam	`PF05859`	Mis12	Family	9	169	9.6e-32	111.3	Mis12 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910921.1
TCTTATTTTTGAATTTGAATACAAAAAAATTAATTAATTGCAAAATCGGTAAACCGTCCATTTTGAAAGGTTAATCGGTGGTTTCCAGCCAAAACCGTTGATTAACTGCTCAAAATCGATGATTTTCCGTTCCGACTAGGCCCGGACGTGACATCGAGGAGGAAAAAGTGCAACTAAACAAGACCAATTTCCTGATAACTCACTGGTGGCGGGAAAATAAAGGAATGGCTATCTCAATTTGAAAACACACCTTCACCAAA...

XM_057910922.1
AGGTTAATCGGTGGTTTCCAGCCAAAACCGTTGATTAACTGCTCAAAATCGATGATTTTCCGTTCCGACTAGGCCCGGACGTGACATCGAGGAGGAAAAAGTGCAACTAAACAAGACCAATTTCCTGATAACTCACTGGTGGCGGGAAAATAAAGGAATGGCTATCTCAATTTGAAAACACACCTTCACCAAACCAAACACTGCTCTCTCCACAAGAACTGGAAAAGGGAAATGGAAGGAGGTAGCAACAGCGAAGCCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987400
ATGGAAGGAGGTAGCAACAGCGAAGCCATATTCGAATCATTAAATCTAGGTCCGCGGCTCTTCATGAATGAGGTTCTCAATGTTGTCGACGATCTGCTTGACGAGGCCTTCAAATTCTTCCTCCAAGAGGCTTCTGTGCGGCTGAAGACGGAGGACACCGATAGATCCGCCGAAGTGAGCAAGGGCGTCTCTTACATTCGGGATTTGATTCAATCGACTCTCGACCAGCGAATGCAGAAGTGGGAAGAATATTGCCTTCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766904.1
MEGGSNSEAIFESLNLGPRLFMNEVLNVVDDLLDEAFKFFLQEASVRLKTEDTDRSAEVSKGVSYIRDLIQSTLDQRMQKWEEYCLRFCFSVPEGFLLPETNGSHGDDSVDLDALTDTEMDAQLNSLRDRLSLLGKESVELARELHALERQSLSSNQSSGSIDEALQLYKDHDASHMFRELTTIASELRTRLGNLKRKRVEETQRHRADKLKENHDHVLGLPCGKGIFGAELEEVEEFLDEIGTS

XP_057766905.1
MEGGSNSEAIFESLNLGPRLFMNEVLNVVDDLLDEAFKFFLQEASVRLKTEDTDRSAEVSKGVSYIRDLIQSTLDQRMQKWEEYCLRFCFSVPEGFLLPETNGSHGDDSVDLDALTDTEMDAQLNSLRDRLSLLGKESVELARELHALERQSLSSNQSSGSIDEALQLYKDHDASHMFRGVKDGSKDNYLIKLGALICSMIFSWPKLLLMCSLNPFIVLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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