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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001759`

染色体: Chr06 坐标: 20574534-20587539 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001759`
名称	SmilChr06G001759
描述	dual specificity protein kinase YAK1 homolog
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20574534 - 20587539 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987404`
GeneID	`130987404`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987404`
原始查询	`LOC130987404`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dual specificity protein kinase YAK1 homolog
产物	dual specificity protein kinase YAK1 homolog
Arabidopsis	`AT5G35980` (YAK1) YAK1-like protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833590] identity=63.3; qcov=0.953; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0702500` - identity=55.1; qcov=0.917; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0004713 (protein tyrosine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0018105 (peptidyl-serine phosphorylation); GO:0018107 (peptidyl-threonine phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987404

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766909.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766909.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057766910.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057766909.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057766909.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20577533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D11
`Chr6:20577658`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A19,B17,B52,C55
`Chr6:20577658`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A19,B17,B52,C55
`Chr6:20585439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C85
`Chr6:20587162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr6:20587163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr6:20587165`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D7
`Chr6:20587165`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766909.1

915 aa

458

915

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 132-341 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 135-346 aa

XP_057766910.1

830 aa

415

830

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 132-341 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 135-346 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766909.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	132	341	3.9e-52	178.0	Protein kinase domain
`XP_057766909.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	135	346	1.5e-22	80.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057766910.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	132	341	2.9e-52	178.4	Protein kinase domain
`XP_057766910.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	135	346	1.2e-22	81.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910926.1
TGCGCTTCTTTTCTACGAAATTACTGCTTTCCGATTACCACAAACATAAACTAATACGTATTTCACAGCTCCTGCTTCCCTTCTCTCCTCTCAATTCGACTCCCCTCGCCTCTGCCAATTCAGATTGATTTCAATCGATTTTCACTTCATCGCCTTTGCTGATTTCTTTGTTTTGTTTCCGTTGAGGCCTCAGCTGGATCGATTGGCTTCACACTCTGTCGTTTTGCCCTTCCCATTCATTATTTTTTCTAGAAAAAAAT...

XM_057910927.1
TTACCACAAACATAAACTAATACGTATTTCACAGCTCCTGCTTCCCTTCTCTCCTCTCAATTCGACTCCCCTCGCCTCTGCCAATTCAGATTGATTTCAATCGATTTTCACTTCATCGCCTTTGCTGATTTCTTTGTTTTGTTTCCGTTGAGGCCTCAGCTGGATCGATTGGCTTCACACTCTGTCGTTTTGCCCTTCCCATTCATTATTTTTTCTAGAAAAAAATAAATTTTGGTATTTGGGTTGTTTTTTATGTGCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987404
ATGGACGAGGTCTCTACTGCTGCTAGTAGGGAAGCTGAATCCCCGCAACTCAGCGAGAGTTCAACATCTTCGTCTTCCTCATCATCCAGGCTAATATCATGGCGCCCTAGGCCGCTTGCCTTCCGCCCTTATTCCTCAACTCTCCACACTAATACCAAGCCCCAACATTTACGGGTCGTCGTCAGAAGACCGTTGGTTGCGCGCTTGACTAAGGATATTGTTGAGATATATCAAGTATGCAACCCTCAGTTCCGTTATTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766909.1
MDEVSTAASREAESPQLSESSTSSSSSSSRLISWRPRPLAFRPYSSTLHTNTKPQHLRVVVRRPLVARLTKDIVEIYQVCNPQFRYSEELNLKRFLTSPSTGLLNDGCDNENSDLILTVNYCLVNSNINQRYIVKDVLGQGTFGQVAKCWVAEMNSFVAVKIIKNLPAFYQQALVEVSILTTLNKKFDPEDKHHIVRIYDYFVHQNHLCIVFELLDVNLYELIKLNHFRGLSLSIVQLFSKQILRGLALMKDAGIIHCDL...

XP_057766910.1
MDEVSTAASREAESPQLSESSTSSSSSSSRLISWRPRPLAFRPYSSTLHTNTKPQHLRVVVRRPLVARLTKDIVEIYQVCNPQFRYSEELNLKRFLTSPSTGLLNDGCDNENSDLILTVNYCLVNSNINQRYIVKDVLGQGTFGQVAKCWVAEMNSFVAVKIIKNLPAFYQQALVEVSILTTLNKKFDPEDKHHIVRIYDYFVHQNHLCIVFELLDVNLYELIKLNHFRGLSLSIVQLFSKQILRGLALMKDAGIIHCDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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