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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002829`

染色体: Chr01 坐标: 46877748-46880103 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002829`
名称	SmilChr01G002829
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20a-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46877748 - 46880103 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987409`
GeneID	`130987409`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987409`
原始查询	`LOC130987409`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20a-like
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20a-like
Arabidopsis	`AT2G28230` (AT2G28230) TATA-binding related factor (TRF) of subunit 20 of Mediator complex [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817369] identity=64.8; qcov=0.986; evalue=5.61e-110; confidence=high
Rice	`Os09g0443500` (OsMED20_1) - identity=56.6; qcov=1.02; evalue=1.1e-96; confidence=high
GO	GO:0003713 (transcription coactivator activity); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016592 (mediator complex)
KEGG	-
Pfam	PF08612 (Med20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987409

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766920.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057766920.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057766920.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766920.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766920.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46877976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,C83
`Chr1:46878055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B134,B3,B49,C18
`Chr1:46879067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:46879109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766920.1

222 aa

111

222

Med20

PF08612 Med20 1-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766920.1`	Pfam	`PF08612`	Med20	Family	1	206	5.9e-53	180.1	TATA-binding related factor (TRF) of subunit 20 of Mediator complex

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910937.1
TATATAGGCGTGTGTTCTTGAGGAATGCAACCATATATATATATATAAAGAATTGCGTTGCTGGAGTATTTCAGGATTTTCAAATTTATTCACCCTTCAACGAGCTTCGATTCGTCGACACTATGCCCATCAAATGGATTTTGCACTGGCAGCCCAACCCGGGCACGACGGTGAACACCCAAATCCTCTCAGAAGTGTCTCAGTGCGCTGAGAGCATCAATGGCGTTAAAGAAGGGCGCTGGAAAACCACTCTCAGTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987409
ATGCCCATCAAATGGATTTTGCACTGGCAGCCCAACCCGGGCACGACGGTGAACACCCAAATCCTCTCAGAAGTGTCTCAGTGCGCTGAGAGCATCAATGGCGTTAAAGAAGGGCGCTGGAAAACCACTCTCAGTTTCTACAAAGCCATGGTCAGAGAACAAGCTATTGCGAATGACTTTCCTCGTGATTTTGTGGGGATTTCGCTTGCGGAGCAGCCCGGCAAATATTTCTTAGTAATTAGAGGGCAGCGTCTTGTAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766920.1
MPIKWILHWQPNPGTTVNTQILSEVSQCAESINGVKEGRWKTTLSFYKAMVREQAIANDFPRDFVGISLAEQPGKYFLVIRGQRLVVEAESSIQMIMEKLQSYKTRVALNFEGNQYQLGDFQLRVGKVVPMNSENLRGIVMEMEYVPISSWEKSREIMGDFFELWQEALSKRSLPGHFVHNEPNFAEYGLPDQYGMQHTAIQYANITAQIVATSQSVQAPRN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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