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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001791`

染色体: Chr06 坐标: 20961707-20969620 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001791`
名称	SmilChr06G001791
描述	transcription factor GTE8-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20961707 - 20969620 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987412`
GeneID	`130987412`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987412`
原始查询	`LOC130987412`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor GTE8-like
产物	transcription factor GTE8-like
Arabidopsis	`AT3G27260` (GTE8) global transcription factor group E8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822345] identity=47.5; qcov=1.03; evalue=6.89e-174; confidence=high
Rice	`Os02g0601800` (OJ1791_B03.42-2) - identity=39.7; qcov=1.06; evalue=4.61e-115; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00439 (Bromodomain); PF17035 (BET)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987412

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766919.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766919.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766919.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766919.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766919.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20962861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B2,B33,C14
`Chr6:20962979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:20963301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:20963319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:20963915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:20964106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:20968602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:20969074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C26
`Chr6:20969078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766919.1

727 aa

364

727

Bromodomain

BET

PF00439 Bromodomain 173-257 aa PF17035 BET 321-384 aa

XP_057766921.1

728 aa

364

728

Bromodomain

BET

PF00439 Bromodomain 173-257 aa PF17035 BET 321-384 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766919.1`	Pfam	`PF00439`	Bromodomain	Domain	173	257	3.7e-22	78.8	Bromodomain
`XP_057766919.1`	Pfam	`PF17035`	BET	Domain	321	384	5.7e-14	52.7	Bromodomain extra-terminal - transcription regulation
`XP_057766921.1`	Pfam	`PF00439`	Bromodomain	Domain	173	257	3.7e-22	78.8	Bromodomain
`XP_057766921.1`	Pfam	`PF17035`	BET	Domain	321	384	5.7e-14	52.7	Bromodomain extra-terminal - transcription regulation

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910938.1
AAGATACCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGAAAAAATAAGAGTGATTGCTTGCGCACACTTTCTCTCTCTATCTACTAGACTACAGATATAGATATACACACTCCCTTTGGAGTTCCGAAGCTTCGGGTAGCTTTCCCTCGGCGACTGGCGCGCTTGATTAGGGGCTCCCTCATTAATCCAGTCGAAGTTTTTTTGTTCTAGGGTTTCCAAACTACTGTGTGTTTCTATACTTTTACGACTTTGTTTTTTCACTTATC...

XM_057910936.1
AGATACCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGAAAAAATAAGAGTGATTGCTTGCGCACACTTTCTCTCTCTATCTACTAGACTACAGATATAGATATACACACTCCCTTTGGAGTTCCGAAGCTTCGGGTAGCTTTCCCTCGGCGACTGGCGCGCTTGATTAGGGGCTCCCTCATTAATCCAGTCGAAGTTTTTTTGTTCTAGGGTTTCCAAACTACTGTGTGTTTCTATACTTTTACGACTTTGTTTTTTCACTTATCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987412
ATGATGGCCAAGAAAGATAGATTCCCCCCTGGGTATTCTGCTAGTGTTGCTCCACATTATGAATCTGAAGGATCTGGCAGCTCGGGACGGATTGACTCAGTTGATGGTTCTTCTGCGTCTAAGAGAAAATGGGTTGATTTGAATTCAGCCTCGAGGGATGGTTTCACTGTACCCATACAAATTATTCCATTGTCCAAATTGTCTTCCTTTGAGAGGAAGAGTTTGGTGCTTCGTCTGACATCGGAGCTTGAGCAGATTCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766919.1
MMAKKDRFPPGYSASVAPHYESEGSGSSGRIDSVDGSSASKRKWVDLNSASRDGFTVPIQIIPLSKLSSFERKSLVLRLTSELEQIRLLQNKVESQKKKTTVNKFTKSNSSDILTCTNGQQKGLQVGNLKKSAMLDSAPGKKARGWNRGITGRFQSASDNSHVNANNATLKQCEGLLKKLMSQQFAWVFNSPVDVVKLNIPDYFTIIKTPMDLGTVKSKLNSGKYSHPLEFLEDVRLTFTNAKTYNPPGSDVHVLAETFS...

XP_057766921.1
MMAKKDRFPPGYSASVAPHYESEGSGSSGRIDSVDGSSASKRKWVDLNSASRDGFTVPIQIIPLSKLSSFERKSLVLRLTSELEQIRLLQNKVESQKKKTTVNKFTKSNSSDILTCTNGQQKGLQVGNLKKSAMLDSAPGKKARGWNRGITGRFQSASDNSHVNANNATLKQCEGLLKKLMSQQFAWVFNSPVDVVKLNIPDYFTIIKTPMDLGTVKSKLNSGKYSHPLEFLEDVRLTFTNAKTYNPPGSDVHVLAETFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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